Jake Sully lever med sin nya familj på planeten Pandora. När ett välbekant hot återvänder för att avsluta det som tidigare påbörjats, måste Jake samarbeta med Neytiri och Na'vi-folkets armé för att skydda deras planet.

Den desillusionerade marinsoldaten Jake Sully skickas till planeten Pandora för att med alla medel övertyga urbefolkningen att låta människan exploatera deras natur för att utvinna en ny energikälla. Allteftersom Jake lär känna planeten och folket blir han mer och mer osäker på sitt uppdrag och när kampen ställs på sin spets måste han välja sida.