Otkad je odlučio trajno prenijeti ljudsku svijest u svoje tijelo Avatara i postati novi vođa naroda Na’vi, Jake Sully živi sa svojom obitelji na Pandori. On i Neytiri su osnovali obitelj i dobili djecu. Kolonizirajuće su se snage vratile na Pandoru kako bi završili prvotnu potragu za rijetkim mineralom, prisiljavajući Jakea i Neytiri da pobjegnu iz svog doma, istražujući do tada nepoznate dijelove Pandore gdje će se upoznati s ljudima Metkayine, klanom domorodaca koji žive okruženi morem.

Priča započinje na Zemlji. Glavni lik Jake Sully, vojnik koji još nije pronašao razlog za što bi se borio, regrutiran je za odlazak na planet Pandora u vrijeme kada je svijet na rubu propasti (gotovo ne postoji niti jedan biljni ili životinjski oblik života, a financijski kolaps je zahvatio sve segmente). Treba zauzeti mjesto svojeg brata koji je poginuo u pokušaju komunikacije s Na'vi vrstom (visoka, mršava i plava bića s dredloksima) koja obitava na planetu Pandora. No, postoje problemi; prvi je to što je Jake invalid (ostao je bez noge tijekom ture kao marinac), a drugi je taj što Na'viji baš i nisu veliki ljubitelji ljudske rase.