“我想我可以說出來了。我與美遊的……至今為止的故事” 世界向著毀滅前進。能夠阻止毀滅的步伐的，唯有身為“聖杯”的美遊的犧牲而已。要選擇世界，還是美遊——。面對發起“世界的救濟”的愛因茲華斯所提出的這個問題，伊莉雅給出的答案是，“拯救雙方”這種單純的“任性”。戰鬥迎來暫時的休止，一行人暫時棲身於美遊與士郎成長的家中。在眾人團聚的途中，士郎開始講述自己與美遊的過去。曾經能夠無差別地實現任何願望的神稚兒美遊。士郎將無家可歸的她帶回了自己與切嗣一同生活過的家裡。在那之後過了5年。兩人如同親兄妹一般度過著平穩的生活。但，這樣的日常卻突然迎來了結束。造訪美遊老家的兩人。在他們的面前，將美遊當成“奇蹟”地追求的朱利安出現了——。美遊與士郎、愛因茲華斯的因緣，在此揭曉。

鹿目圓，本來是一位擁有幸福日常生活的平凡人，直至為了解放殘酷命運連鎖的那天，她賭上身心去改變世界法則，拯救一眾魔法少女。因為極度思念而奇蹟般保存相關記憶的少女，曉美焰，在重組後的世界繼續戰鬥，並一直盼望彼此帶著值得懷緬的歡笑，再次相遇[105]。 鹿目圓的付出，改變了整個世界。而新世界中的魔法少女，所面臨的，是希望？還是絕望？