“我想我可以説出來了。我與美遊的……至今為止的故事” 世界向著毀滅前進。能夠阻止毀滅的步伐的，唯有身為“聖杯”的美遊的犧牲而已。要選擇世界，還是美遊——。面對發起“世界的救濟”的愛因茲華斯所提出的這個問題，伊莉雅給出的答案是，“拯救雙方”這種單純的“任性”。戰鬥迎來暫時的休止，一行人暫時棲身於美遊與士郎成長的家中。在眾人團聚的途中，士郎開始講述自己與美遊的過去。曾經能夠無差別地實現任何願望的神稚兒美遊。士郎將無家可歸的她帶回了自己與切嗣一同生活過的家裡。在那之後過了 5 年。兩人如同親兄妹一般度過著平穩的生活。但，這樣的日常卻突然迎來了結束。造訪美遊老家的兩人。在他們的面前，將美遊當成“奇蹟”地追求的朱利安出現了——。美遊與士郎、愛因茲華斯的因緣，在此揭曉。

Following Madoka's rewriting of the universe, sacrificing herself and her happy normal days to save all magical girls from the cruel fate that awaited them by wiping witches out of existence, the despair still manifest into creatures known as nightmares. Magical girl Homura Akemi continues to fight alone in the hope that she will be able to see Madoka smile again.