Спустя тридцать лет после того, как доктор Сэм Беккет вошел в ускоритель «Квантовый скачок» и исчез, за ним следует новая команда, которая должна возобновить проект в надежде понять тайны, скрывающиеся за машиной и ее создателем.

Three computer-savvy kids, Naoto, Yuka and Ippei created their own videogame superhero, but then discover it possessed by an inter-dimensional police officer, Gridman. Pursuing an evil program called Kahn Digifer, he merges with Naoto and fights Kahn Digifer's digitized monsters in order to prevent the computerized demon from wreaking havoc on the Human World.

Институт кибернетики создал революционный суперкомпьютер - Симулакрон, с помощью которого можно моделировать целые миры и населять их искусственными людьми. Изначально Симулакрон должен был использоваться в благих общественных целях, но глава Института Сискинс начинает осуществлять свои корыстные планы. Помешать Сискинсу, а также разгадать ряд тайн и загадок вокруг суперкомпьютера должен гений компьютерных технологий Фред Штиллер...