春假時，為了購買動畫藍光片而打工的御宅族安藝倫也，在開滿櫻花的坡道上邂逅一位少女，幫她撿一頂被風吹走的貝雷帽。對這名少女感興趣的倫也萌生了製作以她為美少女遊戲女主角的構想「我會讓你變成令人心動不已的女主角！」。

一週後倫也才發現，原來這名少女是他的同班同學加藤惠。為了製作同人遊戲，倫也陸續找來了美術社王牌澤村英梨梨來負責插畫、學年第一名的學姊霞之丘詩羽來寫劇本，一行人以 Comic Market 為目標開始進行遊戲製作……

水明藝術大學附屬高中額外獨立宿舍，通稱「櫻花莊」是群聚了一群充滿各式問題學生入住的特殊公寓，被一般人作為「怪人的巢穴」看待。因無法拋棄棄貓而被趕出一般宿舍的神田空太也是其中的一份子。本來應該以「脫離櫻花莊」為目標的空太，卻由於天才畫家椎名真白的入住，導因於其連穿衣服都無法完全自行處理的「超」生活白癡水準，空太莫名奇妙的肩負起有如寵物般的「飼主」責任，開始了照顧真白和被其耍弄的哭笑不得的日子 ──

被大學退學後第二年的春天，身為家裡蹲廢材的主角佐藤達廣在一事無成下，妄想認為自己的退學跟無職是「NHK」的全國性陰謀。就在這個時候，在他面前出現了之前遇到過叫做中原岬的神秘美少女，並堅持達廣一定要加入計畫治好只會窩在家裡的毛病……

秋里樂葉是熱愛著美少女和美少女遊戲的插畫家。夢想著成為超人氣插畫家而在美少女遊戲製作公司奮鬥著，但現實卻不順遂。因為在社交遊戲全盛時期的現代，公司轉變了方針。樂葉只能擔任插畫家助手，過著每天繪製路人角色背影的日子。在某一天，因為意外的原因從遊戲店的店長手上拿到了過去的知名美少女遊戲。懷念著美少女遊戲的黃金時代，打開了《同級生》的外盒後，樂葉突然被耀眼的光芒包圍，回過神來她已經穿越時空回到了過去。樂葉回到的過去是1992年！這時代正是美少女遊戲的黎明期！來到了名為Alcohol Soft的公司工作的樂葉，心懷美少女、繪製美少女，她能創造出美少女嗎！？獻上對美少女遊戲絕對的熱愛，這名少女的故事…「那麼，就開始吧！」。