只要能从警方手中逃脱三小时，就能获得一大笔钱……！？

一名女高中生身穿用于自杀式爆炸袭击的威力装具，在都市内肆意横行的事件发生了！要阻止她，需要有精准射击目标关键部位的能力。凛为了解决这个事件，召唤了那个男人！

使用‘威尔韦尔’强化部件‘半人马座单元’，有人袭击了警车。这个单元是由艾米莉亚曾效力的波兰警方开发的。另一方面，从现场留下的标记来看，十年前在武器走私案件中辞职的一名前警官出现在了调查线索之中。

第八机动科遭遇紧急状况！无法出动！就在这个时候，一起使用‘威尔韦尔’和炸弹的人质挟持事件发生了。我是第九机动强袭科（通称：第九科）的科长，花咲里浅见！优秀的我和我的部下们将会拯救第八机动科和东京！

即使在罗格斯事件之后，穆托斯仍继续被秘密监禁在警察厅的设施中。黑骑一直挂念着他，抽空就会去探望。就在这时，东京市区发生了一起由摩托车型‘威尔韦尔’引发的失控事件。

在东京各地，多起同时发生的‘威尔韦尔’事件接连爆发。然而，在第八机动科到达之前，所有嫌疑人都已逃离，没有一人被捕。与此同时，阳正前往他以前的同学，壬生知衣子的演唱会，但是……。

一只名为楼陀罗的巨大怪兽突然出现在新宿，向正在拆除中的旧市政厅发起攻击。有人将3D投影仪的影像与之联动，从而引爆了旧市政厅。得知此事的濑名决定亲自展开调查。

作为成功保护全国知事会议免受预告恐怖袭击的奖励，第八机动科和第九科的成员们在一个度假酒店的游泳池享受着小小的假期。然而，一个用于侦察的极小型无人机突然出现……？

在市中心突然发生交通事故和财物损坏，看不见的随机袭击事件频发。濑名依靠留在现场的线索，来到了泥泞区域，并遇到了看似难民的外籍人士阿汀。

装备了吸附装置的‘威尔韦尔’可以在墙壁上自由移动，以此从事工业间谍活动的蜘蛛事件发生了。黑骑得到了圆等人协助，试图将蜘蛛型‘威尔韦尔’引入陷阱。

“他与巴德合作了。”被穆托斯指出这一点后，为了消除疑虑，黑骑与第八机动科的成员们一起开始了调查。

当卫星与地面连接的太空电梯对接仪式和新东京峰会开幕即将举行之际，黑骑他们仍在努力调查。另一方面，掌握了重大爆料证据的小凑，却遭到不明身份者的追杀。

面对首都圈毁灭的危机，第八机动科、第九科以及综合自卫队集结全力。怀着大家的心愿，黑骑向着宇宙进发！