Tras el tiroteo público de Callen al camaleón, no todo está bien con el equipo del NCIS: LA, ya que Callen es suspendido y Hetty se ajusta a la vida retirada.

Un ataque aéreo contra un complejo de fabricación de bombas en Afganistán revela el cuerpo de un Marine recientemente retirado, llevando al equipo de NCIS: LA a investigar por qué el Marine regresó a Afganistán y si traicionó o no al país por el que luchaba.

El equipo del NCIS: LA investiga una operación de inteligencia comprometida después de que cuatro personas vinculadas al proyecto clasificado mueran en la explosión en una cena. Mientras Deeks y Kensi están tras la pista de los involucrados, se enteran de que una adolescente caprichosa podría estar relacionada y Kensi no puede más que ser comprensiva con su situación.

El equipo del NCIS: LA investiga la trágica muerte de empleado de un candidato al Senado de Estados Unidos que es atropellado al cruzar la calle. El caso se convierte en un asunto de seguridad nacional, ya que los agentes deben determinar si se trata de un trágico incidente aislado o un complot con conexiones políticas que podrían poner a otros en peligro.

Cuando un agente que trabajó con Hanna es encontrado muerto por un aparente suicidio, el equipo sospecha que puede sr parte de una conspiración.

El NCIS continúa investigando a muerte de un agente de la CIA que les llevará a un peligroso grupo de agentes rusos.

El equipo del NCIS: LA se dirige a la playa a comprobar la posible relación entre un surfista, un vídeo por Internet y un técnico científico Naval muerto. Mientras tanto, mientras Callen y Hanna investigan las conexiones de inteligencia de la víctima, Deeks y Kensi van encubiertos para atrapar a sus sospechosos y algunas olas.

El equipo del NCIS: LA cuestiona el motivo detrás del asesinato de un agente retirado de la CIA que se hizo millonario y en el proceso también cuestiona lo que Hetty sabe sobre el caso.

El equipo del NCIS: Los Ángeles investiga el robo descarado y extraño ejecutado por hombres armados disfrazados que podría afectar directamente a la economía de Estados Unidos. Mientras tanto, ya que Deeks testifica en un caso, Granger insiste en ir de compañero con Kensi que es muy reacia.

Callen, Sam, Kensi y Deeks pasan la Navidad a bordo de un portaaviones investigando la muerte de un agente especial del NCIS compañero. Mientras tanto, Nell y Eric pasan la mayoría de los días de fiesta en el cuartel general y Hetty hace un viaje.

Una viuda afligida desconfía de las circunstancias que rodearon la última batalla de su marido Marine y Sam y Callen ayudan a determinar si ha habido un encubrimiento. Mientras tanto, Hetty convoca al Psicólogo Operacional Nate Getz para ser su "peón" y el resto del NCIS: LA siente otra evaluación en el horizonte.

Callen va de incógnito para infiltrarse en una red de terroristas Chechenos que están reclutando luchadores extranjeros para unirse a su causa y planeando un ataque en los Estados Unidos.

Callen, Sam, Kensi y Deeks van de incógnito como un equipo táctico de élite para investigar un a emboscada ligada a un capo de un cártel con conexiones terroristas.

Una investigación del NCIS: LA lleva al equipo a interrogar al único superviviente de una antigua organización terrorista, mientras Kensi y Deeks siguen el rastro en el bosque.

Callen está preocupado de que Sam esté demasiado involucrado después de que él lleve un caso de personas desaparecidas por un anciano Afgano que le ayudó hace años cuando fue herido en una misión.

Sam teme por la seguridad de su familia cuando piden a su mujer que retome una antigua tapadera de la CIA después de que un caso sugiera vínculos con el infame Sidorov y su arma nuclear robada.

Mientras el NCIS empieza a investigar el asesinato de un sospechoso de tráfico de armas, les informan de que el arma utilizada fue la misma que se utilizó para matar a un sargento en Idaho menos de 48 horas antes.

Callen y el equipo de NCIS: LA trabajan con París y el equipo NCIS: RED para localizar al sospechoso terrorista Robert Spears.

Cuando cianuro en una jarra de agua comun envenena letalmente a un teniente y deja a un piloto de la Marina en estado grave, el equipo del NCIS: LA investiga si se trata de un incidente aislado o una prueba temprana de la contaminación del agua a gran escala.

Un cuerpo es robado después de que un equipo especial tome con éxito a un infame jefe de un cartel, dejando al equipo del NCIS: LA para investigar la fuga y localizar el cuerpo que falta.

Callen cuestiona las motivaciones de Hetty cuando un extraño caso que involucra a una misteriosa mujer se revela como un agente secreto de su pasado.

Deeks va encubierto para obtener información acerca de un infame traficante de armas que busca volver a estar en el negocio, pero la mujer de la que se hace amigo lleva la operación en una dirección peligrosa. Mientras tanto, Kensi se enfrenta a nuevas emociones mientras vigila a Deeks y su fuente femenina.

Una explosión nuclear en el Pacífico reaviva la búsqueda de las armas nucleares robados y hace a Hetty a mezclar los equipos del NCIS: LA, enviando Callen y Kensi al extranjero y dejando a Sam y Deeks asociados en el lado del estado.