歪歪企图东山再起，诱发全球各地的生态危机，想趁着龙骑团能量耗尽时夺取龙骑手镯。一股沙尘暴向炼油厂逼近，如果炼油厂被毁，将会造成灾难性的污染，啦啦命龙骑团前去应付这些危机，却意外发现了一颗神秘的生命孢子。

蓝猫等人带回的孢子能够净化周围的污染，啦啦觉得从中或许可以找到解决环境危机的办法，于是龙骑小队分工合作，让巴豆作为替补，其余人则合力激活孢子。激活的孢子突然衰竭，大家用能量维持，都遭到排斥，谁都没料到只有巴豆的能量被孢子接受。

司雷将孢子吸收到了体内培育，蓝猫跟菲菲为了给孢子创造一个和谐快乐的生长环境，跟司雷玩起了游戏。土狼装扮成勤杂工，跟踪蓝猫来到了司雷的所在地。菲菲为了拆穿土狼的伪装，将他带回来跟司雷玩游戏，没想到却引发了一场危机。

趁巴豆一个人在公园玩时，土狼使用苦肉计，将巴豆引诱出了保护屏障，假装跟巴豆玩游戏，将他骗到了老板布下的陷阱中。歪歪攻击掉入陷阱的巴豆，企图抢夺龙骑手镯，司雷、巴豆奋勇作战，仍抵不过诡计多端的歪歪，危急时刻，其他龙骑战士赶来了。

司雷中了歪歪的兔子病毒，其余四龙阻挡发病的司雷都受了伤，啦啦发觉，司雷在奔跑的时候，才能控制病毒不发作。蓝猫让菲菲一起去疏通山谷道路，菲菲想逃掉这个脏活，要求留下来照顾司雷，谁知照顾司雷也不是件容易的事，反而使得菲菲吃尽了苦头。

歪歪收到情报，得知司雷的病情已好，多疑的歪歪再次派土狼来打探情报。土狼看到身体健康的司雷，想再一次释放病毒，这时他才发现这是龙骑团的计谋。为了保住司雷和孢子，必须拿到杀毒芯片，于是蓝猫等人与土狼展开了追逐战。

土狼将龙骑团带到了地宫基地后，使计逃出了他们的控制，蓝猫用龙骑手镯查看了地宫的地图，想出一个“捕鼠”方案，将地宫分成四个区域，啸天用火攻封住A、B、C三区，蓝猫封住D区，将歪歪逼出地宫，淘气则在地面守株待兔。虽然作战成功，但是为了保住杀毒芯片，还是让歪歪逃了。

能量之树树苗成功培育出来，为了防止植株被偷，蓝猫跟淘气在基地巡逻。在歪歪的带领下，酷可来到龙骑研究中心挑战，不过在与龙骑团的对决中失败了。另一方面，啦啦发现地球环境不适宜能量之树生长，于是龙骑团赶往类地星球，没想到歪歪等人也尾随而来。

龙骑团一行顺利来到能量之树的来源地，类地星球，在搜寻适合能量之树生长的红土壤时，巴豆不小心触碰到了未知植物，遭到植株的袭击，在蓝猫的努力下，大家化险为夷。虽然危险重重，龙骑团凭借坚强的意志克服困难，找到了了红土壤。

土狼与酷可假装成类地星球的原住居民，来到了龙骑团的住所，菲菲对土狼假扮的原住居民产生怀疑，于是想方设法让土狼露出马脚，不料每次都被酷可施计阻挠。土狼临走时提出要求参观一下，菲菲便带他去爱心花园，在途中设下计谋，打算揭穿土狼真面目。

危急时刻酷可保护了植株，龙骑团感谢万分，接受他们的邀请，前去他们家做客。菲菲心有怀疑，到处敲打，意外的打开了土狼设置的机关，为引龙骑小队陷入圈套，酷可以身犯险，将落入险境的菲菲救了出来。为了救出酷可，蓝猫等人决定再次打开石门。

巴豆一个人守护植株，土狼趁机想要偷取，几次都被巴豆误打误撞阻止，土狼愤怒之极，跳出来与巴豆直面相对。另一方面，蓝猫等人被困底下祭祀场，为了尽快逃离险境，大家四处找寻出口，菲菲在神像前的水晶球里，找到了出口，这时酷可驾驶着黑龙骑出现了。

被困于底下祭祀场的龙骑团，受到黑龙骑纠缠，于是蓝猫接受酷可一对一的挑战，俩人展开了展开了激烈的战斗，蓝猫小胜酷可，酷可不甘心，为了彻底打败蓝猫，同意放走淘气、菲菲、咖喱，蓝猫觉得酷可这个提议可行，便答应了。

巴豆陷入泥沼，土狼轻松偷到植株，危急时刻蓝猫等人赶回，与土狼展开植株争夺战，一番奋战后，还是被土狼抢走一颗植株，跑进崇山峻岭中。为了夺回植株，龙骑团设下层层陷阱，而土狼与酷可也谨慎万分，龙骑团是否能夺回植株呢？

龙骑团成功夺回植株，将土狼打落山崖。土狼醒后遇到了公主艾丽莎，被公主当做神使，还向土狼讲述了这个星球所遭遇到的灾难。土狼将错就错，承认自己就是艾丽莎口中的神使。就在土狼冥想时，被歪歪跟酷可找到，教训了一顿，艾丽莎看到神使被欺负，便与酷可打了起来。

植株突然间狂性大发，为了让植株安稳下来，龙骑团决定将其绑住，这一幕正好被赶来的公主看到，两方产生了误会，展开了战斗，蓝猫发现植株与公主有感应，觉得公主不是坏人，便试图上前解释清楚，不料又被土狼从中作梗，破坏了机会。

土狼利用使者身份，骗公主用霹雳球为黑龙骑升级，但是黑龙骑的黑暗能量与霹雳球的圣洁能量相互排斥，公主产生怀疑，歪歪为了继续骗取公主的信任，编造相互排斥的原因是公主的能量不够纯净，才导致黑龙骑分裂成两个属性完全相反的龙骑。

黑龙骑升级成功，与土狼卷土重来，抢夺植株。升级后的黑龙骑力量突增，司雷不是对手，被打晕过去，蓝猫等人察觉危机，急忙赶来支援，虽然奋力一搏，但还是难当黑龙骑攻击，除了咖喱，其余人等落入黑龙骑旋风幻影中。为了保护植株，咖喱潜力爆发，但最终还是被抢走了一颗。

为了抢回植株，龙骑团与酷可、土狼展开了一场追逐战，在追逐中，蓝猫与菲菲不慎跌落山崖，让酷可跟土狼抢占先机。土狼为了抢功，假装铁爪手刹车失灵，将黑龙骑撞出故障。蓝猫将菲菲送去植株所在的悬浮岛，自己则留下来拖住黑龙骑。

植株陷入危险，如果植株消失对双方都没好处，于是蓝猫提议休战，合力救出植株，酷可思量一番，答应了蓝猫的提议。土狼看到蓝猫占上风，便使计让蓝猫频出意外，菲菲发现土狼搞鬼，果断出手，阻挠酷可取得植株。

植株受到黑龙骑惊吓，出现异化，为了让植株恢复正常，菲菲想到公主的眼泪曾与植株发生过共鸣，于是决定上演催泪大战，巴豆作为爸爸，自告奋勇上阵，经过洋葱、芥末、辣椒水轮番攻击，巴豆终于流出了眼泪，但植株还是未恢复正常。

黑龙骑受伤严重，霹雳球也无法为他完成治疗和升级，只有去龙骑团取得霹雳弹，将其与黑龙骑能量融合互补，才能治疗黑龙骑的伤势。为了给黑龙骑升级，土狼和公主趁夜来抢夺龙骑蛋，俩人使计引菲菲上当，抓住了菲菲，为了通知伙伴来搭救自己，菲菲启动了紧急信号。

歪歪打算利用及帝的能量升级黑龙骑，淘气告诉歪歪若要吸取及帝能量将会消耗他体内极大生命值，歪歪不愿以身犯险，于是打起了公主的主意。淘气诱骗土狼，让他以为歪歪要牺牲自己帮黑龙骑升级，土狼为了保命，接受了淘气的建议，在黑龙骑升级时做了手脚。

土狼和酷可再度来袭，意图夺取植株，龙骑团英勇迎敌，却被酷可冻成冰雕。蓝猫使用烈焰吼将冰融化一半，巴豆保护植株心切，驾驶司雷强行冲破冰雕，紫晶云也得到解救，两人联手对付酷可跟土狼，危急时刻，蓝猫跟菲菲终于赶来支援。

龙骑团能量不足，对抗雨级黑龙骑难有胜算，蓝猫提议三龙合一展开防护罩，阻挡黑龙骑进攻，保护植株。三龙合一后打开防护罩，铃丰能力几度出现短路，发现破绽的黑龙骑对菲菲发起猛攻，防护罩最终被黑龙骑打破。在战斗中蓝猫发现黑龙骑的弱点，决定寻找打败黑龙骑的机会。

在替黑龙骑升级时，公主发现族人的生命信息在衰退，于是让狮子座留下来保护神使，自己去查看具体情况，淘气听到了公主一番话，觉得这是改变公主态度的重要突破口。蓝猫与菲菲前来搭救淘气，菲菲的作战计划进行顺利，就要救出淘气时意外发生了。

蓝猫从淘气那得到生命信息的消息后，与菲菲一起来到圣山。公主因为无法阻止族人生命信息衰竭，伤心落泪，于是菲菲心生一计，决定假扮神使，帮公主将衰竭的生命信息重新点亮。一番周折后，蓝猫用龙骑能量将生命之源送回圣山，菲菲假扮的神使暂时得到公主的信任。

为了验证神使的真假，公主带菲菲回到了基地。歪歪得知菲菲是神使后，提议让他跟土狼进行一场神力展示，以便公主判断谁是真正的神使。土狼在比试中输了两个回合，公主对土狼产生了怀疑，歪歪不甘失败，便提出让菲菲展现神力，证明自己是真神使。

蓝猫发现鸟粪能让植株迅速生长，便跟巴豆一起去采集鸟粪，谁知带回来的鸟粪反而让植株枯萎了，蓝猫总结原因，小鸟在自然状态下产生的鸟粪才能让植株加速生长，于是跟巴豆在植株周围营造舒适的环境，吸引小鸟，功夫不负有心人，小鸟带着一群同伴回来了。

植株健康的长势让巴豆很开心，也因为很久没有吃甜饼，巴豆决定吃甜饼庆祝下，谁知植株受到甜饼气味的影响枯萎了，为了植株的健康，蓝猫让巴豆戒掉甜饼。土狼听到甜饼气味会影响植株生长，于是做甜饼引诱巴豆，间接伤害植株。

借助双月奇观，公主恢复了霹雳球的能力，救出了淘气。歪歪告诉公主，圣山能量出现问题，生命信息纷纷掉落，公主惊慌失措之下求助神使菲菲，于是大家前往圣山。原来这一切都是歪歪的阴谋，菲菲为了治疗生命信息，最终暴露了假神使的身份。

公主利用菲菲的龙蛋，将黑龙骑完全升至雨级，歪歪命令酷可立刻前去夺取植株。淘气回来告诉蓝猫、巴豆菲菲的情况，这时酷可驾驶黑龙骑前来袭击，为了保护植株，淘气主动请缨，引开黑龙骑，让蓝猫、巴豆带着植株离开。

歪歪用菲菲的生命威胁蓝猫，成功抢到了生命之树。为了加速生命之树成长，歪歪为他们输入营养液，不料被生命之树抵抗。为了异化生命之树，歪歪派土狼去破植株的中枢保护系统，自己则负责营养液的输入，土狼在破坏植株过程中反被植株攻击，歪歪也尝到了自作孽的恶果。

龙骑团找到被异化的植株，巴豆看到植株无法自控，闯进了魔化森林。菲菲想到巴豆的眼泪是净化植株最好的东西，便让巴豆使劲哭，没想到植株异化严重，感动之泪也没作用。于是蓝猫、巴豆、菲菲三人撑起防护罩，阻断了给植株输送营养液的管道。

啦啦来到类地星球，而龙骑团只剩下蓝猫和菲菲两人，为了解救生命之树，蓝猫攻击圣地幻境，逼公主将生命之花显现出来，菲菲趁机夺取，公主因为消耗太多能量，失去生命之花会有生命危险，于是蓝猫将生命之花还给了公主，解救生命之树的方法，只有让蓝猫成为第六龙骑士。

要成为第六手镯，并且激活第六手镯的三个元素体，就必须让啸天释放生命能量。啦啦激活了元素体的炼炉，而蓝猫在收取元素体时必须通过烈焰的煎熬。啸天不忍蓝猫受苦，在收取第一个元素体后啸天转头离开，为了保护龙骑手镯不被毁，啦啦让菲菲赶快找回啸天。

啦啦将蓝猫送入升级第六龙骑手镯的黑洞中，让菲菲守护在防护圈外，防止歪歪跟黑龙骑进入防护圈内捣乱。黑龙骑果不其然来捣乱，啦啦用尽能量也未能阻止，于是让菲菲模仿小飞虫，缠绕黑龙骑惹他发怒，然后趁机攻击他右腿的能量网。

蓝猫来到了升级环境深处，这次的考验是要拿到第六龙骑的标志。蓝猫在拿取标志时，受到了植物的攻击，在躲避攻击时，拔下了堵着瘴气口的木塞，植物受到瘴气的毒害全部枯萎，看到倒下的植物，蓝猫将瘴气口重新堵上，植物恢复了生机,成功取得第六龙骑标志。

土狼带着公主前往植株森林，吸取巴豆泪晶。歪歪为了表现出巴豆与植株不友好的假象，向植株森林投放虫子。土狼想将巴豆骗出森林，便挖地洞偷袭，结果被巴豆教训一番，公主看到土狼遭受欺负，冲进来搭救。虽然巴豆的泪晶被公主取走，但他一直告诉植株公主是朋友，不能伤害她。

啦啦感应到巴豆处于险境，同菲菲赶去支援。果真发现能量之树出现异化，将巴豆裹在里面，为了救出巴豆，菲菲跟啦啦分工合作，菲菲安抚藤条，吸引藤条的注意力，啦啦趁机营救，终于将巴豆救了出来，但是巴豆不忍心丢了巴小豆，最终回到了植株身边。

啦啦使用奥茨玛能量，帮公主稳定了生命信息，但是公主不相信啦啦，啦啦建议她去用霹雳球治疗生命之树，如果治疗中出现大地律动，就能证明是歪歪在骗人，于是公主去歪歪基地，验证啦啦所说的话。歪歪见欺骗公主之事被识破，便索性跟公主争斗起来。

公主去往圣山，遭到歪歪跟土狼追击，歪歪在攻击能量波中加入了追踪信号，公主发现后将信号器转移到豪猪身上，转移土狼跟歪歪的注意力。土狼埋伏在去往圣山的路上，发现公主却不忍伤害她，还替她创造逃跑的机会。虽然有土狼相助，但还是没能逃脱被歪歪捉住的命运。

狮子座将霹雳球带给在圣山等候的啦啦，这时歪歪跟黑龙骑追来，夺取霹雳球，啦啦借助霹雳球的能量，将黑龙骑变成了龙蛋，趁机逃走，但是歪歪破坏了生命信息，为了保护生命信息，啦啦又赶了回来。歪歪命令酷可发起攻击，狮子座牺牲了自己，保护了啦啦，保护了生命信息。

啦啦使用霹雳球，让植株森林恢复健康，形成了第二阶段环境的入口，蓝猫再次进入进行第六手镯升级。为了阻止手镯升级，歪歪给酷可了一个装置，只要黑龙骑使出雨量攻击就可激活，但是却没告诉酷可一旦激活后黑龙骑便会失控，不知情的酷可在与蓝猫战斗中，启用了装置。

酷可知道自己被利用后，来找歪歪算账，歪歪用生命信息威胁酷可，暂时保住了一命。酷可命令土狼监视歪歪治疗生命信息，自己则赶去治疗被腐化的能量之树。歪歪为了摆脱土狼对自己的监视，把土狼再度收入自己麾下，骗土狼吃下了含有电子芯片的食物。

啦啦跟公主利用心灵感应，破除了歪歪的能量牢房，也知道她俩原来是姐妹。这时歪歪跟土狼出现，啦啦跟公主破除能量牢房消耗过多能量，不宜恋战，于是制造进攻假象，趁机逃脱。啦啦跟公主去魔化森林，谁知歪歪在途中布下了陷阱，俩人陷入危机中。

歪歪将蓝猫从升级环境中拽了出来，啦啦跟公主及时赶到，公主牺牲自己，帮助蓝猫重新营造了升级环境。蓝猫重新进入升级环境进行升级，啦啦在外牵制歪歪，虽然困难重重，蓝猫最终完成了第六龙骑手镯的升级，挽救了公主星球上的生命与圣树，并带着金色果子，回到了地球。