身在大都市的克拉克依旧受红色氪石的影响，迷失本性的他，犯下了许多错误。在得知克拉克的行为后，肯特夫妇担心不已。风流倜傥玉树临风的莱克斯在一个荒无人烟的孤岛上受尽折磨。

乔纳森和克拉克打得难分难解，最后克拉克自己毁掉了红色氪石戒指，恢复了正常，跟着父亲回到了农场。莱克斯以为是父亲莱诺设计了自己，回来找父亲算帐，莱诺却认为是海伦做的。

一个叫Jake Pollen的鱼鳃人在游泳池袭击拉娜时被人用枪击毙。克萝依不想再调查克拉克，莱昂却威胁要解雇她的父亲，克萝依只有服从。

克拉克不断在现实和梦境中交替，在梦境里遇到一个叫sara的女子不断向他求助，她说总是有人要追杀她，一个穿红色斗缝的有强大力量的人。

克拉克通过触摸亲生父亲Jor-El留下的氪星首饰感受到42年前的一段情景，原来，他的父亲当年被派来地球接受成人的考验时爱上了一个女孩（恰巧是拉娜的姑姑），后来卷入了这个女孩的被谋杀案。在逃走的时候Jor-El得到了乔纳森父亲的信任和帮助。克拉克这才知道，原来小时侯他被送到肯特农场不是偶然的。

暗恋拉娜的zegers受伤后在医院接受核磁共振时获得了神奇的磁性控制能力，他控制了拉娜的思想，使拉娜不由自主地喜欢上他。莱克斯开始调查小时候祖父母死于火灾的真相，他怀疑是父亲做的。

莱克斯找到了整容之后的摩根，收集了莱昂伙同摩根杀死祖父母骗取保险金的证据。在知道莱克斯调查自己之后，莱昂安排保镖给莱克斯下迷幻药，并安排了一次假刺杀，让别人认为莱克斯发疯了。

克拉克到精神病院看望莱克斯，同时见到了关在这里的Van,Eric和Ian,莱克斯求克拉克用超能力救他出去，克拉克没有答应。知道莱克斯逃跑失败后被严密禁锢起来，克拉克很内疚。

在一次制止抢劫珠宝店的事件中，克拉克被绿色陨石发出的光芒把眼睛灼伤了，暂时失明了。但却引发了他的超级听力，并听到了莱昂和克萝依的对话，并开始知道莱昂要克萝依调查他。

克萝依得罪了莱昂，被报社解雇了，走之前将她近期的调查磁盘留给了主编Max.在路瑟公司，一名叫Molly的女子偷走了原来克萝依的电脑中的硬盘。

一个新转来的学生Jordan Cross只要触碰别人就会预感到这个人临死前的情景，克拉克通过他的异常表现救了想自杀的体育老师Altman，原来Altman因为女儿意外不治而想追随女儿。

乔纳森住院了。在夜里，克拉克发现了皮特加入参与Dante的车队进行黑市赛车，皮特使用了有陨石的燃料使车辆速度如飞。克拉克提醒他，皮特根本不听，认为这样才能展现自我。

在一次电梯事故中，克拉克使用超能力进行自救，同行的Alicia用意念将两人转移出来。在分享彼此的秘密后，克拉克和Alicia惺惺相惜，都以为找到了自己的真爱。

乔纳森住院了，医生建议做心脏手术。在医院里，Garrett目睹哥哥因严重肝病死去。可是第二天，Vincent却奇迹般出现在Garrett和克拉克面前，但随后又病倒。Vincent告诉克拉克是大都会的一个女医生给他注射了一支针剂才使他复活的。

克拉克和皮特在青年救助热线里接到了拉娜的紧急求助电话，他正在被Adam追杀，可是事实上什么也没有发生。

根据Jor-El和乔纳森之前做的交易，Jor-El开始通过八角型钥匙召唤乔纳森，克拉克到山洞去弄清楚原因，却被莱昂发现了洞壁上的钥匙槽被重新打开了，于是莱昂重新展开对山洞的研究。

克萝依闯入莱克斯的研究所，被一种研究气体感染，获得使人说真话的能力，这是一个记者梦寐以求的能力，她陶醉于这种新的改变，不自觉地伤害了身边的一些人，包括把Taylor老师的往年犯罪记录发表在报刊上。

莱克斯与加纳医生的恢复近期记忆的合作有了意外进展，加纳用陨石水疗法使莱克斯逐渐回忆起小时候的一些片段。

莱昂的研究队伍在山洞里发现了一件文物，在请Willowbrook教授鉴别的时候，却被他的学生Jeremiah抢了去，原来这是一把丢失了500年的星刃，它会赐予持有者神奇的超能力。

拉娜要前往巴黎了，莱克斯为她安排好机票。克拉克想向拉娜坦白自己的一切秘密，可是拉娜小时侯的好朋友的克隆体Emily逃出来劫持了她，在克萝依的帮助下，克拉克找到了囚禁拉娜的地方救回了她。

一个从山洞走出的自称是氪星来的女孩Kara找到克拉克，她知道克拉克的一切，她要带克拉克回山洞接受Jor-El的指引，以让克拉克完成本身的使命。