環境省官員天海拜訪了特立獨行的地震學家田所博士。根據後者推斷，關都地區面臨沉沒的危機。

在日之島沉沒後，日本首相認為田所提出的理論毫無根據。一篇雜誌文章危及天海的事業。

副首相不願相信田所的驚人預測，於是天海試圖説服一位知名的科學家來核查相關數據。

關都可能沉沒的消息突然公之於眾，導致居民們人心惶惶，所有交易停止。天海提出了一個疎散計劃。

關東地區傷亡慘重。天海得知女兒所乘坐的巴士因隧道事故被困，他決心去尋找女兒。

田所博士被捕後，天海向一個意想不到的人尋求科學數據方面的幫助。安置計劃遇到意想不到的阻礙。

日本危機和安置協商的新聞傳遍世界，該國公民開始對政府失去信心。

針對首相的恐怖襲擊震驚了世界。天海的團隊繼續進行安置工作。與此同時，人們發現了一種新的傳染病。

其他國家由於變異毒株禁止日本移民入境，而科學家們爭分奪秒，希望能及時研製出解藥。