夜斗是个为了5元的香火钱，连跑腿送货的委托都能接受的无家可归的流浪神。身为他的“神器”的同伴伴音对他“生理上就排斥”，而伴音随后也向夜斗提出辞职，不再担当他的神器。于是某一天，没了神器的夜斗接了个寻找走失的小猫的委托。在寻找走失的小猫的途中，差点被卡车撞到的夜斗，被一位名叫壹岐日和的少女所救。

因为车祸的关系，日和成了时不时就会灵魂出窍的“半妖”。为了治好这种不方便而危险的体质，日和向夜斗寻求帮助，但夜斗以“没有神器没办法”而拒绝行动。没办法，日和只好亲自帮忙去找适合成为神器的死灵，但却误打误撞引来了妖怪。夜斗没有神器无法战斗，只好带着日和的魂魄一起逃走。在逃到住宅区的时候，一个如雪般的死灵的身影映入了夜斗的眼睛……

雪音成了夜斗的新神器，但由于待遇很差，雪音对夜斗很是不满。夜斗叫来了日和，但结果却只是让她请客。好不容易来了委托的电话，结果前往的地方居然学问之神“天神大人”——菅原道真的神社。由于天神气场强大，神器众多而美丽，很有神明的风范，让雪音和日和都不禁顶礼膜拜。夜斗和天神一番贫嘴后说起了正事，而这次的委托是因为应考季节很忙，所以天神想让夜斗帮个忙……

即使雪音成为了夜斗的新神器，但夜斗的“经营状况”依旧惨淡。面对没多少长进的夜斗，日和没少数落他，多次提醒他别忘了自己的委托，也别让雪音受苦，夜斗突然一本正经地对她说“有几个人想介绍给你认识”。说着，夜斗把他们带到一位名为“小福”的女子家中。这位小福其实是名为“惠比寿小福”的神祇，有一位名为大黑的面相可怕的神器。而夜斗带他们过来，也有着自己的打算。

刚刚成为神器的雪音渐渐掌握起神器所特有的能力。然而夜斗的种种表现，让日和坚信夜斗无法成为合格的监护人。因此日和决定把雪音接到自己家里，由自己照顾。另一方面，一直留意夜斗的动向的毘沙门，也得知夜斗获得了新的神器。

雪音正在被“魔”不断侵蚀，终于，在他经过上次的体育用品店时没抵抗住邪念，仗着自己已是不容易被别人认知到的死灵，把滑板偷了出来。逢魔时刻，夜斗找到了雪音，面对夜斗的诘问，雪音撒谎说滑板是日和给他买的，而这时日和也恰巧赶到，夜斗便让雪音与日和对质。在夜斗仓促应战匆匆逃离之后，被留下来的日和想起了之前夜斗的告诫——“如果我出了什么事的话，就去找他们”。

夜斗与毘沙门一役，以突然赶到的小福用大黑打开了通往黄泉的“风穴”，“时化”骤起妖怪大量涌出而暂靠一段落。雪音在之后离开日和的家，来到天神的神社，想离开夜斗，让天神把自己收为神器，但被拒绝。雪音依然在邪念的驱使下继续做出刺伤夜斗的举动，夜斗也因身上的“安无”（ヤスミ，也称“恙”，神明因神器的堕落而被不洁的异质感染）而越来越虚弱。

夜斗与雪音新接到委托，来自于日和同校的学生——荻原学，一个面对同级生的欺凌，只会懦弱地独自流泪而不去行动起来勇敢反抗的孩子。然而，面对这样的场所——只要是活着的学生每天都能来的的学校，已是死灵的雪音的心中又会生出怎样的感触、掀起怎样的波澜呢？

由于雪音所犯的种种错误，夜斗被“恙”折磨得越来越严重，陷入了极度危险的状态。为了拯救夜斗，必须对让他陷于此境的神器——雪音进行“禊”，让他对自己的种种罪行做出真正的忏悔。然而，要进行“禊”，则需要有三名其他神器……

日和参观附近的神社来迎接新年。野良和一个名叫“蠃蚌”的邪恶灾难之神对她有其他计划，不过……

日和神奇地失去了对夜斗的所有记忆。当夜斗努力帮助她记起时，野良和蠃蚌继续着他们的计划。