主人公·有马拓也在两个月前失去了自己的父亲，在生活的各个方面丧失了活力。就在这样的某天，他从应该死去了的父亲那里收到了神秘装置和一封信。“收集宝玉，然后今晚10点到剑之岬来。”按照指示来到了剑之岬（三角山）的拓也却……

帮助了遭到袭击的拓也和亚由美的，竟然是丰富。总算是得救了的拓也和亚由美。与此同时，因为在剑之岬所发生的神秘事故，吉欧科技公司也遭到了激烈的工程反对运动。工程负责人的亚由美被慢慢地逼上了绝路……

证明了亚由美的清白，并成功解救了她的拓也，由于混沌矫正的作用下而再次前往了新的平行世界。拓也与澪、结城一起来到了有着作祟骚动传言的地点·龙藏寺的住宅中。而后龙藏寺提出了要与拓也两个人谈话……

在父亲·岛津市长的安排下澪要突然转学到国际学校去了。留在这座城镇的所剩无几的时间里，澪为了解开三角山的谜团而卯足了干劲，还因此受了伤。在保健室被拓也包扎了伤口的澪，打算向他阐明一切事情……

本应该只对拓也说过的秘密被公布于世，非常伤心的澪打算利用剩余的时间到三角山进行搜索，决定要离家出走。拓也和美月、结城一起开始寻找澪，而这时结城却突然说出了真相……

寻找澪而潜入了三角山洞穴的拓也，利用反射器装置规避了无数次的危机，终于来到了澪的身边。而出现在寻找着出口的拓也面前的是……

在三角山地下寻找着出口的拓也和澪。到达的场所存在着令人意想不到的某种东西……以及在那里出现的美月的意图是……

拓也由于混沌矫正的作用下再次去往了新的平行世界。拓也为了能仔细地调查龙藏寺而去寻找绘里子的帮忙，但这时的绘里子看起来和平时不一样……而后出现在潜入龙藏寺家与协助者见面的两人面前的是……

拓也和绘里子暂时离开了龙藏寺的宅邸，但两人在龙藏寺的阴谋下遭到了拘束。虽然拓也使用反射装置总算避免了危机，但是也付出了很大的代价……而后得以揭晓的龙藏寺的真面目到底是……