MacGyver faces off with a cunning new adversary whose carefully crafted plans put Mac at the epicenter of an impossible choice: save the life of a friend, or save the lives of hundreds of innocents. Also, Mac receives new information that will drive a wedge between him and his father.

Läget är kritiskt när en bomb är nära på att slå ut hela övervakningsteamet. MacGyver rekryteras för att lokalisera den misstänkte men det visar sig att de blivit lurade. Frågan är om ett nytt samarbete kan få rättvisan att skipas.

Nervositeten är stor när MacGyver ger sig av för att träffa Desis föräldrar. Allt går enligt planerna tills det visar sig att hennes bror är i trubbel. På andra sidan stan inser Russ och Matty att deras nya kollega är försvunnen.