火星军官要求公开认错平息局势，霍顿拒绝服从命令。隐形飞船再次袭击唐纳哥号，双方爆发火力冲突。霍顿发现隐形飞船的目的是陷害火星，舰长遂命令洛佩斯护送霍顿逃回火星指挥处作证。关押船员的地方损坏，内奥米等人陷入绝境。敌人登上唐纳哥号，霍顿强迫洛佩斯救出濒死的船员。洛佩斯拼死护送霍顿几人进入逃生船，随后舰长亲自引爆了唐纳哥号。

逃生飞船收到第谷空间站指挥官约翰逊的消息，霍顿决定前往第谷空间站，内奥米却坚决反对。米勒从寻获的线索中推测真相，他认为朱莉在寻找阿努比斯号上的某样神秘物品。外行星联盟组织的人接近米勒，想要打探朱莉的消息。采冰船摧毁一事在小行星带引发动乱，霍顿被认为已经遇害。十一年前一群矿工劫持空间站，约翰逊无视他们的投降屠杀了所有人。

内奥米最终被说服，霍顿进入第谷空间站。霍顿在同伴的协助下控制了空间站，他和约翰逊达成合作，答应帮助约翰逊寻找斯科普里号的幸存者波兰斯基。米勒被外行星联盟组织绑架，他不肯屈从遂被对方处死，幸好关键时刻好友塔维赶到救了他。约翰逊正在建设最大的宇宙飞船，副国务卿认为他和外行星联盟组织有关。米勒找到朱莉失踪的真正原因，上司却被收买夺走证据，而米勒则被警局开除。

霍顿发现了隐形飞船阿努比斯号，他在登船探索后认定这就是击毁采冰船的真凶，而种种迹象显示有人曾经从这艘飞船上逃走。阿努比斯号藏有神秘的生化武器，霍顿炸毁这艘飞船并前往爱神星。米勒抵达爱神星，他查出朱莉化名为波兰斯基。霍顿找到波兰斯基居住的旅馆，间谍借机逃跑却引发枪战，米勒前来寻人卷入此事，最终米勒和霍顿在旅馆中找到了朱莉的恐怖尸体。

七周前朱莉乘坐斯科普里号想要拦截生化武器，岂料她反被神秘人劫持，随后神秘人发出求救信号最终引诱击毁了采冰船。朱莉设法逃回到爱神星却不慎沾染生化病毒，她的身体产生恐怖异变。父亲得知朱莉死亡，他开启了神秘计划。约翰逊拿出火星军官遗体上的芯片资料，声称是地球人毁掉了唐纳哥号。爱神星宣布发生辐射危害，所有人都被关进避难所，而这是一场有计划的阴谋。

在佛雷德·约翰逊和外行星联盟组织的帮助下，米勒、霍顿和船员们策划一起突袭以获取关于原分子病毒的信息。在地球，阿瓦萨拉了解到关于佛雷德·约翰逊的真像。

霍顿和米勒对突袭的成果进行调查。

米勒制定了一个危险的计划，以根除爱神星上的原子分子病毒。

罗西南多号追赶冲向地球的小行星。

地球和火星在小行星碰撞后寻找答案。

地球/火星和平会议的筹备工作加剧了厄林怀特的紧张情绪。

内奥米追踪原分子病毒的踪迹。佛雷德·约翰逊对外行星联盟组织的控制崩溃。

罗西南多号的船员处理了内奥米背叛的余波。在地球和火星之间的战争中，被困的阿瓦萨拉和博比策划了一个逃生计划。

地球和火星之间的最后一战威胁着人类的未来。一个新的怪物在普洛斯彼罗站释放。安娜收到了她需要的烟枪。

阿瓦萨拉面临联合国军事行动的后果。阿什福德和德鲁默对他们在外行星联盟内的未来做出重大决定。伊罗斯蔓延的疾病感染了阿莫斯。亚历克斯和内奥米冒险营救。

霍顿试图说服弗雷德·约翰逊销毁原分子的最后一个样本。内奥米找到了她儿子的重要线索。在月球上，阿瓦萨拉开始寻找马可·伊纳罗斯。

霍顿和弗雷德在第谷对付渗透者。德鲁默的过去又回来困扰着她。阿莫斯返回巴尔的摩。亚历克斯和博比在火星上的调查引向了腐败军人。

内奥米见到了菲利普。霍尔顿和弗雷德扭转局面。阿瓦萨拉接近了马可的阴谋。

马可的宏大阴谋震惊了地球、火星和小行星带。