Kazuya Soga, un hombre bajo custodia, es llevado a un tribunal para testificar por sus supuestos "crímenes contra la humanidad" en la guerra de Qhardistani. Los flashbacks de la guerra muestran que le está dando agua a una niña dentro de un búnker. Afirma que quiere que la verdad se haga pública. Mientras tanto, uno de una serie de Logicoma producidos en masa se sincroniza con imágenes de video de los hombres de Soga que buscan probar su inocencia. El Mayor revisa esta unidad más tarde y es informado del hecho. Aramaki le ordena que investigue este asunto. Kusanagi se va con el Logicoma en cuestión y sospecha que le han implantado recuerdos falsos. Entran en una carretera y son atacados por una camioneta tripulada por hombres armados. La Mayor entra a la fuerza con su motocicleta y ve a Batou the Ranger como el conductor

Atrapado en un laberinto de barreras, Soga explica que llegará a la "caja de Pandora" antes de que el Mayor pueda detenerlo. Decide dividirse en varias copias virtuales y buscar pistas en el laberinto dentro de la memoria de Soga. El Mayor encuentra el día de la Guerra Qhardistani en cuestión. Ella es testigo de cómo su equipo masacra a los refugiados mientras Soga explica que fue la misión final de la Unidad Compuesta 78. Se muestra que le ordena a uno de sus hombres que le dé una botella de agua, que rápidamente le da a uno de los niños refugiados que la bebe y le sonríe. Sin embargo, el Mayor ve una discrepancia visual en este recuerdo. Ella intenta decirle a Soga que lo habían infiltrado, pero se corta de su red. VV la saca a la fuerza del laberinto de la barrera y ambos continúan infiltrándose en el área.

A Logicoma being tried for unspecified charges.