Having just discovered a new virus that could drive man to extinction, a young doctor begins a video journal to track her progress in preventing a global pandemic.

Dr. Scott outlines her theory on how global warming might have exposed the modern world to an ancient virus to which we have no natural immunity.

Dr. Scott pleads with her government benefactors for a ship to take her to the arctic so she can trace the deadly virus to its possible source.

Despite ridicule from her fellow scientists, Dr. Scott's concern over the new virus is amplified by the discovery of three new cases outside the original hot zone.

Dr. Scott shares her research with someone close to her - along with a plea to avoid populated areas - as she prepares to chase down a cure for the rapidly spreading virus.

About to board the USS Nathan James, Dr. Rachel Scott imparts a final note of urgency about the threat that mankind faces, revealing that the fate of humanity hangs on the success of her mission.

Tom Chandler舰长和美国海军阿利·伯克级驱逐舰“内森·詹姆斯号”的全体船员正在北极圈内执行为期四个月的常规任务。船上搭乘了两名滤过性病原体学者——Rachel Scott博士和Quincy Tophet博士，告诉Chandler舰长他们将在目的地从事鸟类研究。当他们遭遇一群叛变的俄罗斯士兵的袭击之后，Chandler这才发现这两名病毒专家的真正任务是收集一种致命病毒的病原体样本。七个月前，这种致命病毒开始在全球范围内爆发。当“内森·詹姆斯号”在巴伦支海游弋的时候，这种病毒已经导致全球过半人口死亡。重新组建的美国临时政府命令“内森·詹姆斯号”立刻返回美国本土，但Chandler和他的船员知道那已不再是他们离开时的家园，他们一旦回去就会成为被利用的工具。要想成功研制出抗毒解药，最安全的地方就是大海——在他们自己的船上。

Chandler和他的团队前往位于关塔那摩湾的美军基地寻找食物和医用补给品，同时为"内森·詹姆斯号”补充燃油。Chandler派出三个小组分别执行这三项任务。当来到关塔那摩之后，他们立刻遭到从监狱中逃脱的囚犯的攻击。他们发现一个头发花白的私人承包商独自在岛上生存了数个星期——既没有被病毒感染，也没有被逃犯杀死。他们希望此人能够帮助他们突破囚犯的防线，但此人态度极其生硬。美国海军在此人的帮助下消灭了囚犯，但在最后却遭遇了俄罗斯海军。

一个新敌人要求Chandler交出Rachel及其研究成果，“内森·詹姆斯号”面临新的挑战。Chandler拒绝了对方的要求，他和他的船员们必须采用一系列大胆而冒险的战略行动来逃过一劫。但他们没有想到对手也有杀手锏，他们在寻找解药的较量中丝毫不落下风。

“内森·詹姆斯号”逃离了关塔那摩湾后，开始往哥斯达黎加驶去。副轮机长钟在轮机室内听到了一些声音，就让另外两个助手拉起过滤器检查，没想到，着火了。舰桥顿时拉起警报，之后开始检查，发现海水吸入口被水草堵住了，导致故障。钟与Chandler舰长说明情况。这时，船上已经剩3000加仑淡水。许多人也病倒了，Chandler舰长让剩下的发电机发出的电分给CIC和斯科特博士的实验室。翌日，轮机发动了一小时就不再转动了，舰长、钟、二副和斯科特博士一起来到轮机室查看情况。他们开始商量对策。第三天，Chandler舰长发现起风了，就让舰员们把昨天准备的降落伞打到空中去，船才得以发动。舰内也有电了在舰桥内，格兰德森上尉用望远镜看到了海鸥，大家也看见了陆地。chandler舰长说着淡水。然后，全员就踏上陆地。

Rachel在疫苗的研制工作上即将取得重大突破，但她和Chandler、Slattery必须到尼加拉瓜的丛林中去一趟——去找一些猴子来进行疫苗测试。然而这趟丛林之旅却充满了危险，他们正面遭遇一位穷凶极恶的前毒贩：公牛，此人决心不惜一切代价维护自己对当地社区的奴役和统治。Chandler和他的手下人面临着巨大的道德困境：消灭这个暴君并解救无辜的百姓，还是带上他们需要的东西一走了之?结果他们选择了前者，最后让那片地区自由了。

虽然“内森·詹姆斯号”的船员安全返回船上,但尼加拉瓜的恐怖经历成为他们的梦魇.当Danny Green患上一种可能与病毒有关的神秘疾病之后,恐慌情绪在船上快速传播开来.Chandler已经对Rachel和她失败的病毒疫苗实验失去信心,但他不得不拼尽全力约束越来越失去控制的船员.如果他无法将船员们重新团结起来,他们的终极任务必将失败。

在经历了长久的航行后，“内森·詹姆斯号”的船员反复听到了一个呼救信号。经过确认后，发现是同一个女人。博士推测出这个女人可能携带有对病毒的免疫基因，于是“内森詹姆斯号”的船员出发去营救。同时，俄罗斯基洛夫级巡洋舰发现了“内森詹姆斯号”，于是他们决定去堵截前去营救的船员们。经过一番激战后，“内森·詹姆斯号”的舰长与另一名船员不幸落水。虽舰长明令不能寻找，但船员们依然派出了搜救队，无果。最后，终于有直升机将二人救起，但等待他们的，却是俄罗斯人······

Chandler和Tex陷入危险境地,Slattery必须临时担任“内森-詹姆斯号”的指挥官.Slattery面临两难抉择:一边是拯救世界的重要任务,另一边是营救身陷险境的舰长。他必须想出一个万全之策来救回自己人,同时确保船上最重要的财产（原型疫苗），不落入他人之手。

Rachel和Chandler决定招募六名志愿者参与抗病毒血清的人体试验,但是对参与者来说,当病毒与血清在他们的身体里发生激烈反应之时,那种滋味简直生不如死。与此同时在美国本土,Chandler的妻子和父亲竭尽全力确保一家人生存下去。

Chandler和他的船员们终于回到家园。他们发现一名前华盛顿权力阶层中的重要人物正试图恢复法律与秩序，但一个危险的军阀可能导致她的努力化为泡影。Chandler等人目前已经掌握了完成“化解病毒危机”任务的方式、方法和具体地点，Chandler决心要拯救危在旦夕的家人，但他很快意识到这个全新的世界正面临一些非常可怕的事情。

埃及开罗爆发一种快速传播的恶性疾病，美国疾控中心专家Rachel Scott医生来到当地查看情况。眼前的惨状令Rachel心情沉重。当地医生告诉Rachel，只要病人身上出现斑点，他们最多还能活两天。Rachel对这种疾病无能为力，她只是从最新的病人身上抽取血液样本后便匆匆离开了。

Rachel表示一旦从卡拉腹中孩子身上提取到治愈药，卡拉以及“内森·詹姆斯号”上的所有人一定会被杀。千钧一发之际，舰长带领伙伴们展开救援行动。

Rachel接到导师Dr.Hunter的电话很是激动，眼含热泪表示自己很健康的活着，并且已经研制出治疗恶性疾病的药物。

美国海军平静号医务船在两周前离开诺福克军港，并且经过特殊改造，Rachel怀疑这就是诺福克那个消失的实验室。

“内森·詹姆斯号”航行中监测到一艘运行相当平静的潜艇，因距离较远，而无法判断其运行航向，同时潜艇也监测到了驱逐舰并打算拦截。

Dr.Hunter在袭击前给Rachel发了一段视频，视频中Dr.Hunter说自己已经找到了治愈药的研究方法，但未来得及把配方传给Rachel就遭到了袭击。

“内森·詹姆斯号”在牙买加附近收到一个紧急求救信号，Chandler率领一支小分队展开营救任务。但是他们遭遇一场出人意料的攻击，Chandler和Tex被困在大海之上。Slattery和其他船员不顾一切地搜寻在海上失踪的船长和战友。如果让敌人抢先找到他们，后果不堪设想。

Mike Slattery看到了一段关于副总统的视频，她表示如果Scott博士研制出治愈药，船员们就必须立刻赶回国。然而当船员们赶回国的时候却发现形势不容乐观。他们在研究如何大批量生产治愈药时遇到了麻烦。与此同时，Chandler舰长等人在视频中观察着Slattery对这些消息会作何反应。

Scott邀请Niels一起看看她关于雾化治愈药物的研究，而这一研究需要贻贝。Wolf和Cruz负责去采集贻贝。船员们遇到了Ray Diaz，他是一名大二学生，曾有人告诉他们海军所发的治愈药其实是在注射病毒，并给了他们食物和枪支。Chandler舰长希望通过Ray Diaz找到这些赏金猎人。

船员们抓获了三名俘虏，他们在俘虏身上发现了无法使用的手机，希望得知这些手机的用途，破解手机网络。与此同时，Scott博士表明自己要研究如何改造疫苗。而舰长等人也在调查着Niels的死因

新奥尔良陷入一片火海，船员们尽全力把幸存者从水里救出来。船长从眼镜蛇小队处得知，被冲上岸的残骸里有水雷的碎片，看起来像是绑在了一艘帆船的船体上。情况紧急，船长下令继续搜救，并随时向他报告情况。

舰长下令不等拉姆齐先发制人，要与他们决一死战。舰长计划让总统先生与最具经验的船员一起登陆。总统先生作为最高统帅，当然不同意这样的安排，可他也别无选择。

总统通过广播号召全国人民到达临近的港口接受治愈传染的药物，并公布了詹姆斯号未来几天具体的停泊位置。民众得知这一消息大受鼓舞，但船员们却为詹姆斯号的安危表示担忧。

钱德勒舰长被派往亚洲去调查可能发生变异的恐怖病毒，“内森·詹姆斯号”副指挥官Slattery和他的船员们向东南亚地区提供治疗服务，但是发现随时都有可能会出现不可预测的威胁。

钱德勒舰长必须想一个带他的部下返回的方法，并开始调查一个危机的陌生的敌人。

钱德勒和船员们在亚洲的道奇城寻找到案，Slattery开始揭露令他不安的艰难处境的真相。

钱德勒必须面对他的新敌人，Slattery对所谓的病毒变异有了更进一步的了解。随着局势的恶化，总统先生的压力越来越大。

随着处境的恶化，钱德勒的任务变得复杂起来。同时，总统先生迎来各地区领导人的烦恼和担忧。

当钱德勒准备完成计划中最后一部分时，他的任务临近结束。而总统先生担忧起他的仕途命运。

“内森·詹姆斯号”必须躲避巨大的威胁。在圣路易斯市的一个意外发现将总统先生致于一个可怕的境地。

当钱德勒进一步研究可能发生的病毒变异时，一场悲剧在美国悄无声息的到来。

钱德勒找到一个可以解决威胁问题的线索。Kara在白宫做了一些深入的调查。

当白宫的命令下达时，钱德勒无比艰难地做着决定。

钱德勒与劲敌免不了来一场终极对决。Kara加入了一个可以帮她完成使命的团伙。

钱德勒回到了美国，他想弄明白到底发生了什么。

为国一战终于到了头，钱德勒接受的挑战可能永远改变他的生活。

在挫败美国政变16个月后，内森·詹姆斯必须面对另一场全球灾难。问题是，汤姆·钱德勒到底在哪里？

在失去了唯一的线索后，内森·詹姆斯号的船员继续寻找一种可以拯救世界的物品。钱德勒沉浸在复仇的使命中。

内森·詹姆斯的船员们在寻找一件珍贵的物品，将他们带到一个富庶而暴力的陌生地方，在那里他们与一个最意想不到的盟友相遇。

当敌人从四面八方逼近时，船员们搜索自己的敌人。斯莱特里被过去的景象所困扰。

当内森·詹姆斯接到一艘拖网渔船发出的可疑求救信号时，他们的任务被转移了。

巨大的风暴即将来临，内森·詹姆斯必须在同样可怕的威胁下航行，才能安全抵达。

搜索仍在继续进行，但当一个老敌人重新出现时，情况变得非常激烈。

在死亡之地的一次秘密行动导致了令人不安的关于Vellek博士邪恶计划的揭露。

内森·詹姆斯号的船员面临着一种威胁，这将考验他们海军战术和战略的局限性。

钱德勒在最后的决战中面对他的敌人和他的个人恶魔，人类的命运岌岌可危。

在战胜全球饥荒三年后，美国海军准备推出自红色流感大流行以来第一支功能齐全的舰队，但一种新的威胁可能意味着下一次世界大战。

追溯到第二次大战时期的军事技术，内森·詹姆斯必须快速思考，才能以有限的武器能力生存下来。

在国家被迅速占领的情况下，钱德勒试图在外交上团结两个敌对国家，以便他们能够对抗共同的敌人。

钱德勒令人难以忘怀的幻象变成了现实，内森·詹姆斯和她的盟友试图阻止敌人向北移动。

经过几个月的战斗，内森詹姆斯的船员必须开始一项危险的任务，以确保重要的情报，可以决定战争的命运。

内森詹姆斯必须得到一个著名的叛军领导人的帮助，以建立一个集结区，然后发动自己的入侵。

经过几天的战斗，秃鹫队必须找到一个秘密的敌人营地。

钱德勒必须制定一个计划，以避免失去一切，而毁灭性的人质情况发生在国内。

船员们为他们迄今为止最雄心勃勃的任务做准备。

钱德勒必须面对他的恐惧，面对他所遇到的最大威胁。