火箭队的老大坂木命令火箭队的每个人都休假。火箭队三人组的各位在神奥地区的湖畔高级宾馆度假悠闲放松的时候，偶然遇到小智与小豪来调查。说着“这是一个抓住皮卡丘的好机会！”并热血沸腾的火箭队三人组，但在这里工作的话就是违反命令。就在这时，坂木的秘书真鸟率领火箭队的精锐部队出现，夺走了岛上的宝可梦。火箭队三人组隐瞒了身份，协助了小智他们！？

小豪报名参加了“鲤鱼王跳高大会”。但是小豪的鲤鱼王胖乎乎的，好像怎么也拿不了优胜。于是小豪参考了大会的绝对王者春旺的肌肉训练动画，开始了对鲤鱼王的特训。

小智和小豪来到了呆呆兽之岛，那里放眼望去到处都是呆呆兽。接着呆呆王的出现，让小智发生了神秘的变化。

继续停留在伽勒尔地区的小智与小豪，他们在那里遇到了胆小爱哭的宝可梦泪眼蜥。泪眼蜥很害怕，马上就哭了。由于眼泪中含有的成分影响，小智他们的眼泪也止不住了。泪眼蜥一碰到水就消失了，小智他们的眼泪也止住了，但泪眼蜥的身影却消失了。与此同时，火箭队也来到了伽勒尔地区。