Gdy baza Ikar zostaje zaatakowana, mieszkańcy zmuszeni są uciekać przez Gwiezdne Wrota. Baza została stworzona na odległej planecie, aby skorzystać z potężnego źródła energii. Ich celem jest próba określenia celu tajemniczego dziewiątego symbolu Gwiezdnych Wrot, której nigdy nie udało im się zamknąć. Przejeżdżając przez Gwiezdne Wrota, nie są one transportowane na Ziemię, ale do bardzo starego, najwyraźniej niezamieszkanego, ale ogromnego statku kosmicznego. . Gdy dowódca grupy został ranny, porucznik Scott i główny naukowiec, dr Nicholas Rush, prowadzą eksplorację statku. Kilka obszarów statku zostało uszkodzonych, ale zasadniczo funkcjonuje. Są w stanie nauczyć się, że są to w rzeczywistości miliardy lat świetlnych od Ziemi.

Ci, którzy przeżyli, przybywają na niezamieszkany statek pływający miliardy lat świetlnych od Ziemi. Panika rozprzestrzenia się w grupie, a płk Young, który został ciężko ranny podczas ucieczki, przekazuje dowództwo porucznikowi Matthewowi Scottowi, zanim zapadnie w nieświadomość. Zespoły prowadzone przez Dr. Rusha i Sgt. Greer stara się zrozumieć sytuację, a porucznik Tamara Johansen, medyk, który spędził kilka dni przed opuszczeniem programu, zostaje wcielony do roli głównego oficera medycznego.

Wraz z nieudanym zasilaniem powietrza w Przeznaczeniu, zespół wyrusza na pustynną planetę w poszukiwaniu minerału potrzebnego do oczyszczenia powietrza z dwutlenku węgla statku. Po przetestowaniu licznych próbek piasku bez powodzenia i przy szybkim zamykaniu okna, grupa decyduje się podzielić na dwie części, aby pokryć więcej ziemi, pomimo nieznośnego upału.

The survivors arrive on an uninhabited ship floating billions of light years away from Earth. Panic spreads throughout the group and Col. Young, who was severely injured during the escape, transfers command to Lt. Matthew Scott, before lapsing into unconsciousness. Teams led by Dr. Rush and Sgt. Greer try to make sense of the situation, while Lt. Tamara Johansen, a medic who was days away from leaving the program, is thrust into the role of chief medical officer.

With the air supply failing on the Destiny, a team disembarks to a desert-like planet in search of the mineral needed to scrub the ship’s air of carbon dioxide. After testing numerous sand samples without success, and with their window of opportunity closing fast, the group opts to split into two to cover more ground, despite the unbearable heat.

Gdy statek jest na kursie kolizyjnym, załoga musi zdecydować, kto zostanie, a kto ucieknie na promie, aby znaleźć nadającą się do zamieszkania planetę.

Ciężkie racjonowanie nie może uratować kurczące się zasoby Destiny, zmuszając pułkownika Younga i porucznika Scotta do szukania pitnej wody na śmiercionośnej lodowej planecie.

Odwiedzając nowo odkrytą planetę dżungli, załoga jest zdumiona, by odzyskać Kino przy bramie. Pobierając dane Kino, Eli odkrywa wideo zespołu, który prawdopodobnie został postrzelony podczas wcześniejszej wizyty. Tajemnica powstania wideo staje się drugorzędną kwestią, ponieważ członkowie zespołu zaczynają chorować.

Dr. Rush nadzoruje eksplorację nowych obszarów statku. Poszukując zasobów ułatwiających codzienne życie, załoga natknęła się na kawałek starożytnej technologii, która niesie obietnicę drogi do domu. Choć trochę zaznajomiony z tym znaleziskiem, dr Rush nie może zagwarantować bezpieczeństwa korzystania z niego, przynosząc mu i płk. Youngowi dystans do tego, co robić.

Wszyscy są zszokowani, gdy członek załogi zostaje znaleziony martwy z powodu rany postrzałowej. Choć na pierwszy rzut oka wydaje się, że to samobójstwo, pistoletu nigdzie nie można znaleźć. Załoga jest ograniczona do kwater, podczas gdy odbywa się rewizja i kiedy broń pojawia się w kwaterach płk Younga, staje się podejrzanym numer jeden.