12岁的小杰为了像父亲一样成为猎人，在达成与扶养他长大的米特阿姨的约定后，踏上猎人试验的旅途。在前往试验会场的船上，小杰遇见了同样是要成为猎人的雷欧力跟酷拉皮卡。他们两人互看彼此不顺眼，进而争执不休。

抵达试验会场所在地的小杰、雷欧力与酷拉皮卡等三人，照着船长的指示走向通往试验会场的捷径。当走到贫民窟时，有位老婆婆率领了一群人在路上等着他们。老婆婆向他们提问，若是答不出来就立刻淘汰。

三人在凶狸狐的带领之下，终于进入试验会场，而会场内也早已经聚集了许多的考生。像是自称试验老手的东巴、散发诡谲氛围的西索、话讲个不停的忍者半藏，以及手持滑板的少年奇犽等。第一次试验即将展开。

第一次试验的内容就是跟着考官萨特次走到第二次试验会场。在单调又见不到终点的路线上，开始陆续出现脱退者。而跟着酷拉皮卡一起跑的雷欧力虽然也跑得越来越吃力，但基于他对猎人的执着，还是一直紧跟在后。在过了80公里后，眼前出现了阶梯，但萨特次的步伐却又加快了。

在通过漫长的地下隧道后，出现在考生面前的是浓雾弥漫的湿地地带。由于视线不佳，考生们一直遭到各式各样的怪物袭击。小杰与奇犽跑在前头，但在后方的酷拉皮卡跟雷欧力眼前，却看到西索被其他考生团团包围。

在与西索对峙之后，小杰等人顺利抵达第二次试验的会场。担任第二次试验考官的门淇与卜哈剌所开出的考题是要考生们做料理。于是考生们为了做出让美食猎人门淇感到满意的料理而努力。究竟，会不会出现令门淇满意的料理呢？

小杰等人在顺利结束第二次试验后，搭上了前往第三次试验会场的飞行船。小杰与奇犽在飞行船内探险时巧遇尼特罗会长，并与其展开对决。而且明明只是从尼特罗手中抢到球的单纯小游戏，却演变成只要赢过尼特罗便能成为猎人。

飞行船抵达的目的地是第三次试验会场陷阱塔的顶楼，只要能在72小时之内，活着抵达地面上就算合格。小杰、奇犽、酷拉皮卡与雷欧力等四人好不容易进入塔内，却陷入了必须凑满五个人才能继续前进的窘境。究竟第五个人会是谁？

小杰等人必须在四场比赛中赢得三场才行。而在第二场时，小杰面临到的比赛是只要让蜡烛的火先熄灭的人就输。却没想到，小杰拿的蜡烛上暗藏玄机。而下一场酷拉皮卡要和连续杀人犯——喳唬进行死斗。酷拉皮卡虽接受死斗，却意外发现喳唬背上有象征幻影旅团的蜘蛛刺青。

本以为在小杰与酷拉皮卡取胜，比分变成二胜一败时，敌人却主张喳唬只是昏过去而已，跟酷拉皮卡之间并没有分出胜负。相对于不愿意给予喳唬最后一击的酷拉皮卡，雷欧力却因为焦虑而显得越来越烦躁。五人之间开始弥漫着不平静的气氛，时间也逐渐一分一秒的过去。

雷欧力跟对方进行的是比剩余时间为筹码的赌局。一回神，雷欧力的筹码竟然只剩下10小时。被逼到无路可退的雷欧力所选的方式是猜拳。雷欧力虽然信心十足，在心理战上却完全败给了对手。二胜二败，在已经没有退路的状态下，胜负的关键就寄托在奇犽身上。

五个人各自度过50小时的等待时间。就在再度前进，以表决克服了重重难关后，就在时间大概只剩1个小时的时候，众人的眼前出现了两扇门。一条是可以五人通行的艰苦远路，另一条则是只能三人通行的简单捷径。五个人又必须再以表决决定要走的路，他们的选择究竟是…

扶养小杰长大的米特一直很担心去参加猎人试验的小杰。就在这时候，米特收到小杰寄来的信，内容提到自在猎人试验一路上所经历的事情、认识的同伴等，还有目前突破的难关。

前往第四次试验考场——赛比掳岛的考生们，在那里所面临到的试验内容，是自己所抽中的号码牌有3分、自己的号码牌也是3分，除此之外的全都是1分，考生必须在一个星期内凑满6分，这样就能过关。而小杰所抽到号码居然是44号！

小杰由嗜血蝶找出他的猎物——西索，并且在一旁企图以拿手的钓竿伺机抢夺西索的号码牌。而另一方面，雷欧力虽被东巴所骗，连号码牌都被抢走了，但在酷拉皮卡相助之下成功夺回。在得知彼此并不是对方的猎物之后，酷拉皮卡与雷欧力组成了共同战线。

酷拉皮卡与雷欧力虽然被西索锁定，但在交涉之后，得以免于一战。不过，无法抑制杀气的西索还是继续寻找下个目标。就在西索攻击目标的一瞬间，小杰成功用钓竿抢到了西索的号码牌，没想到在他准备逃走的时候，号码牌却被其他考生抢走了。

奇犽与尾随他的伊目礼三兄弟战斗，轻而易举地就胜利了。另一方面，小杰与雷欧力跟酷拉皮卡会合，为了抢夺雷欧力的目标——彭丝的号码牌而拟定计划。三人循着彭丝的气息来到可疑的洞窟，可是雷欧力执意单独进入洞窟之中，没想到…

小杰等人在洞窟当中被毒蛇团团围住，但布下毒蛇陷阱的巴鹏却早已经死亡，无法解除毒蛇的包围，而被毒蛇咬伤的雷欧力情况不断在恶化。后来，小杰总算是顺利通过试验了，但在进行下个试验之前，留到最终试验的考生都必须接受尼特罗的面试。

小杰一行人终于来到最终试验，最终试验是赢的人就能先合格的淘汰赛！在杀了对手即失去资格的规则下，进行的第一场比赛是小杰vs半藏。虽然小杰对半藏毫无招架之力，却也没有认输的打算。最后失去耐性的半藏甚至威胁说要折断小杰的手。

小杰在与半藏的决斗中被折断了手，等他在病房醒过来时，萨特次便告知他已经通过试验的事。但听到唯一的淘汰者是奇犽时，难以置信的小杰从萨特次口中得知奇犽在跟哥哥伊耳谜决斗时的状况。

「如果奇犽是被迫成为杀手就绝不原谅！」对伊耳谜怒气大发的小杰，为了带回奇犽而决定前往枯枯戮山。而萨特次在目送小杰一行人离开的同时，口中还喃喃说着「猎人试验还没有结束。」