空军一号核武士官在和总统共进午餐之后突然抽搐身亡。海军犯罪调查处（NCIS）的吉布斯奉命来调查死因。FBI、特勤局等机构在空军一号上各执一词，吉布斯等人瞒天过海抢得先机，开始全面调查。正当事情一筹莫展，又有一名海军上尉在自己的车里死去。