Gibbs接到任務調查一艘船，船隻突然爆炸，Gibbs被炸成重傷。送往醫院後，Gibbs陷入昏迷，過去的種種痛苦記憶不斷在腦海中重現。小組的其他成員不得不放下對Gibbs的擔心，繼續著手調查這個案件。Tony代替Gibbs接管大局，弄出了不少麻煩。

Gibbs尚未從爆炸的受傷中復原過來。小組成員不得不在沒有Gibbs的情況下獨自解決恐怖組織的案子。當Gibbs的良師益友、舊日的上司來訪時，看到Gibbs的記憶只停留在妻女喪失之後的那段日子。小組在調查中發現Gibbs是唯一一個目睹過恐怖分子襲擊計劃的人，他的幫助尤其重要。Gibbs必須在恐怖分子發動襲擊前恢復記憶 。

Ziva偶然目睹了一場政治性暗殺的全過程。Gibbs正享受著退休生活，因此Ziva只能獨自處理自己出現在現場這一巧合。她知道FBI正到處搜索自己，因此躲藏起來。現在由Tony帶領的NCIS小組努力證明Ziva的清白。然而當事態變得更複雜，Ziva只得向一直相信她的人—Gibbs求助

警察逮捕一個持有武器的男人時，一倆載有屍體的車撞向了警車。被逮捕的男人是俄羅斯人，而國土安全局聲稱該男子是為他們工作的。這個俄羅斯人和Gibbs前上司Mike Franks 以前辦的一個舊案子有關聯。Mike 中斷退休生活回來將他繩之於法。

一个被认为已经冻死的海军在Ducky的验尸台上复活。NCIS研究他最近几天的活动情况，试图找出在他身上发生什么以及谁要致他于死地。随着调查的进行，他们发现受害者通过货运机穿梭于巴格达和美国之间。并发现一些与Gibbs过去有关的事情。

一名前任NCIS探員突然死亡，NCIS小組在追緝凶手時，也被凶手追殺，陷入生命危險

NCIS繼續追緝殺死探員的凶手，他們必須在有限的時間內找出凶手，因為他的下一個目標是老大吉布斯。在案情尚未明朗前，這個任務需要每個組員同心協力，然而卻頂撞了副處長的權威。

軍火販在與男子交易槍枝，朝屋頂隨意試槍射擊，竟從屋頂掉落一名海陸士兵屍體，艾米利歐撒拉薩這名士兵遭人雙腳銬住，犯罪現場疑點重重，牆上用血寫的可疑號碼，竟是吉布斯的軍籍號碼？

吉布斯親手打造的木船「凱莉號」，意外被發現載了兩具屍體漂流在聖地牙哥港，吉布斯說他今年的唯一休假就是把船運到墨西哥，將傳送給他的乾女兒，船與命案有何關連？這究竟是怎麼一回事？

吉布斯前往墨西哥面对他的恶魔并做出了一个令人吃惊的决定。

吉布斯必须采取绝望的措施，以保护他的亲人帕洛玛雷诺萨仍然逍遥法外。

在新的证据显示，港口杀手已经渗透到该机构后，NCIS团队在一场追踪他的比赛中竭尽全力。

在NCIS第八季的大结局中，当NCIS成员与臭名昭著的港口杀手面对面时，他们的生命正处于危险之中。

一次日常的早餐咖啡，吉布斯面对面着枪口，迫使他质疑自己过去和现在所做的选择。

国际社会对杀害Eli David的凶手的追捕变成了对Gibbs和团队的联邦政治迫害，这对他们的非常规方法提出了质疑，并威胁到他们在该机构的未来。

一名假冒士兵的女性遭谋杀，Gibbs和McGee前往阿富汗进行调查。这起案件让他们发现一个 Mike Franks秘密支持多年的阿富汗女性庇护所。

NCIS正在狂热地调查一个通过互联网招募青少年的全球恐怖组织，此前海外发生了一起致命的爆炸事件，给该团队带来了令人震惊的损失。

被枪杀后，吉布斯在一艘海军医院船上为自己的生命而战，而迪诺佐和乔安娜则前往上海，试图击落“呼叫号”。

NCIS在一起贿赂和欺诈案中的一名涉案人员被发现在一名跑步者被一个奇怪的声音带到自己的身体后被谋杀。此外，麦基和黛利拉在是查明婴儿的性别还是保持惊喜的问题上意见不一。