大洋航空公司815航班客机从悉尼飞往洛杉矶，却在空中断开并坠毁于南太平洋一座热带荒岛上，机上48人幸存。奇怪的巨响从森林中传出，树木也一批批地倒下。杰克、凯特和查理出发寻找飞机驾驶舱，准备用飞机上的发射器发出求救信号。他们也找到了生还的副驾驶员，但不久后被那只神秘的“怪物”杀死了。而一个回叙就显示杰克在飞机上。

一组生还者一起往内陆行进，并准备在更高的地方用接收器收到更好的讯号。路上，他们被一头北极熊袭击，索耶一枪把它打死了。海滩上，一位联邦执法官在手术中醒了过来，并问医生杰克凯特在那里。回叙中，那位执法官正在押送凯特。在另一个回叙里，查理正把一包小小的海洛因偷带上机。

杰克了解到凯特是名通缉犯。寻找讯号的人回来了，却决定并不告诉其他人有关信号的事。索耶射死了执法官，把他从痛苦中解脱出来。不过，他射偏了，只打中了肺部，因此杰克让执法官安乐死。回叙描述凯特在一个澳洲农场里的生活，直到她被执法官抓到。

机舱在被野猪搜掠后被烧毁。洛克成功地猎到了一头野猪。他遇上了那只怪物，但是他并没有告诉任何人。又到了回叙里，显示出他在飞机坠毁之前坐在轮椅上，却在失事后痊愈了。

布恩为了帮助大家而偷去越来越少的淡水，但这愚蠢的行动引来了其他人的鄙视。已经一段时间没有睡过觉的杰克追着他看见的去世的父亲进入森林中，幸运地，他发现了满是清水的洞穴。杰克回来时做着领导的角色。回叙中，他去了澳洲认回他爸爸的遗体。

一部分生还者搬到了洞穴那边，剩下的仍然留在海边等待救援。洛克以查理失去的吉他换取海洛因，并劝他戒毒。权真秀揍了麦可一顿，因为他拿着真秀岳父的手表；不过，当中只有他的妻子白善华明白事情的起因，因为他们夫妻都不会说英语。人们把真秀用手铐锁在飞机碎片上。后来善华告诉麦可她其实会说英语并解释真秀为何要打他，所以不久后麦可放了真秀。回叙描述真秀为了和善华结婚而为他岳父工作。结婚后的一天晚上，真秀回家时全身布满了人家的血。善华秘密地安排离开真秀，可是最后她还是回心转意了。

查理在痛苦地挣扎著没有毒品的痛苦，并要求洛克把海洛因还给他，而洛克却说查理第三次问他要的时候他就会给他。查理最终第三次问他要海洛因，他给他了，但是查理一手把海洛因丢进了火堆里。回到了以前，查理和哥哥Liam在DriveSHAFT乐队里，渐渐地，Liam让查理染上了毒瘾。几年后，查理在澳洲找到了Liam的家并想他重入DriveSHAFT，但Liam一口干脆地拒绝了。

大家都怀疑索耶藏起了从碎片中找到的哮喘呼吸器。于是萨伊德用刑逼供，不过最后索耶告诉凯特他并没有把呼吸器藏起来。萨伊德为了对折磨索耶的事情负责，独个儿出发探索小岛的海岸线。凯特读了索耶一直带在身边的一封信，才明白“索耶”是他的假名。其实他小时候，一个名叫索耶的男人和他妈妈上了床，骗了她许多钱，而后来他爸爸把她杀了，再自杀身亡。小小的索耶誓言要把这封信交给真正的索耶。不久后，小索耶也成了一个骗子，并自称索耶。回叙里面，索耶准备骗一对夫妻，但当他看见他们还有一个儿子的时候放弃了行动。

萨伊德发现了一条电缆从森林中伸延下海。他沿着电缆走着走着，他被卢梭设下的陷阱抓住了，而卢梭就是那个发出求救信号的女人。卢梭告诉萨伊德她是一个科学探索队的成员，而他们在十六年前触礁来到岛上。她说岛上有一群原著人并称他们为“其他人”，而她的队友却生了一种奇怪的病死去，最后她说那些其他人在森林中细语。萨伊德逃脱了，带上卢梭的步枪和她在岛上写下的笔记。回去的途中，萨伊德听到了卢梭提到的细语。回到以前，萨伊德被要求拷问一位名为娜蒂娅的罪犯——他的童年好友。他的上司要他处决了她，他却帮助娜蒂娅逃跑。

受伤的萨伊德回到了营地，并把卢梭和岛上“其他人”的事告诉了大家。克莱尔连续两晚醒来时都大叫大喊，并称有人把她按在地上，想要捅她的肚子。这驱使赫利用飞机上的乘客名单作人口调查，却发现伊森并不在那架飞机上。回叙中，克莱尔知道自己怀孕了，不过她的男友离开了她。她于是找到了一位通灵者，说道巨大的危险将发生在她的婴儿身上。

克莱尔和查理被伊森绑架后，杰克和凯特、洛克和布恩分别组成两队寻找他们。杰克遇上了伊森，而伊森却警告其中一人将会被杀。杰克和凯特找到了查理，他当时被懞上眼睛并被人挂在树枝上，吊着脖子。杰克非常生气，立即用心肺复苏法救回了垂死的查理。同时，布恩和洛克发现了一块金属陷在森林中的泥地里。又到了回叙，杰克一口承认他父亲在酒后施行手术。

在湖中游泳时，凯特发现了那个执法官的手提箱。杰克说要是凯特肯告诉他里面的东西的话，他就会帮她打开箱子。里面原来有几把枪和一架玩具飞机。凯特告诉杰克那架玩具飞机属于她曾经爱过、却杀害的人。回叙里，凯特抢劫了银行，才能找回那架玩具飞机。

香农和萨伊德的关系越来越亲近。而洛克和布恩就向进入他们发现的那个舱门中。布恩原想把这件事告诉香农，但是洛克给了他一些草药，导致他产生幻觉，放下对香农的感情。到了回叙中，布恩想给钱赶走虐待香农的男友，最终却发觉这只是香农设下的骗局；而香农不久后和布恩上了床。

烦恼的麦可批评了刚向洛克练习飞刀法的沃特，并命令他帮他用飞机残骸造一个筏子，沃特却径自走开了。麦可和洛克跟着沃特进入森林，这时沃特竟然被一只北极熊困住。麦可奋不顾身地救了沃特，也和他和好了。后来，洛克和布恩看见克莱尔从森林里跌跌撞撞地走出来。回叙描述当沃特只有几个月大的时候，他妈妈接受了一份在阿姆斯特丹的工作，并把儿子也带上了。她在沃特两岁时和一个名布赖恩的工作伙伴结了婚，也不让麦可和儿子说话。几年过去了，苏森过世了，布莱恩并不向交管沃特，原因是这个小孩很“特别”。

克莱尔回到了生还者之中，不过她记得的最后一件事却是那趟飞行。查理使伊森十分愤怒,于是伊森威胁查理要是他再不把克莱尔交出来,他会把营地里的人一个一个地杀光。尽管大家都做好了防备措施，斯高特仍然被杀。带着手提箱里面的枪械，并以克莱尔作为诱饵，杰克、凯特、洛克、萨伊德和索耶设下了一个陷阱，并成功地抓到了伊森。原本的计划是活捉伊森，可是抱着仇恨的查理一枪杀了他。回叙中，查理为了赚取买毒品的钱，准备从一名少女下手。

索耶为了找搜劫他帐篷的野猪而烦恼，他便和凯特一起在森林里寻找，而他找到时并没有杀它。索耶更把枪交给了的杰克，而杰克现在拥有所有从手提箱里发现的枪械。索耶想起原来他在澳洲曾经遇到过杰克的爸爸。在回叙里面，索耶在澳洲找到了一个人，以为他就是骗了他家钱的“索耶”，并一手毁了他一生。他杀了那人，才发现自己杀错了人。

麦可继续建造著自己的筏子。索耶用建造材料换取了筏子上的一个座位，因此那里只剩下一个座位。不过那只筏子不久后着火了，而所有人都把责任怪在真秀头上。第二天早上，麦可狠狠地打了他一顿。善华阻止了麦可，并说真秀并没有烧掉木筏。大家包括真秀都对她会说英语而十分惊讶。洛克就认为这是“其他人”做的。麦可则无奈地建造另一只更好的新筏子。善华去安慰真秀，而真秀却说要重新开始太迟了。真秀回到了海滩上，帮助麦可重建木筏，使他拿到了一个座位。沃特跟洛克承认是他烧毁了木筏，因为他喜欢这个岛。到了回叙里，显示出那次真秀全身是血，是由于他揍了一个人、救了这个人，因为善华的爸爸要真秀杀了他。最后夫妻两人决定到美国过新生活。

赫利发现卢梭的笔记中重复写着4、8、15、16、23和42，这些数字就是使他中乐透头奖的号码。因此他独个儿出发寻找卢梭问个究竟。卢梭说，她并不知道数字的意思；并且说她的科学队是朝着不断发出这些数字的信号来到这个荒岛的。这些数字后来又被发现印在那个舱门的边上。回叙里，赫利赢了头奖，而在接下来的几个星期里，他身边的每一个人都遭到了厄运。

洛克发觉他的腿开始没有知觉了。他和布恩根据他的梦境发现了一架Beechcraft 18挂在悬崖的边上。布恩爬了上去，成功地使用了无线电通讯器，发出了一通紧急求救电话：“我们是大洋航空公司815航班的生还者！”而一个男人（柏纳）回答：“我们也是大洋航空公司815航班的生还者！”那架飞机掉了下来，洛克于是背着受重伤的布恩回到了营地。洛克到达了洞穴并编造了他受伤的原因，又不知不觉消失在丛林中。他不断敲打着舱门，又向着舱门大叫，突然舱里射出了强光。到回叙中，洛克见回了父母，可是父亲却骗取了他的一个肾脏。

虽然洛克叫布恩不要告诉任何人有关舱门的事情，受伤的布恩却告诉了杰克。尽管杰克努力救他，布恩最终还是死去了。另一边，克莱尔则生下了一个男婴。回叙描述杰克和萨拉的婚礼，萨拉曾经是他从车祸伤患中拯救回来的病人。

洛克参加了布恩葬礼，而杰克却揍了他。洛克希望香农原谅他，但是香农从熟睡的杰克偷走了一把枪，在准备杀洛克的时候，萨伊德推走了她，那时子弹擦过了洛克的额头。萨伊德要洛克带他到舱门那里。

萨伊德和洛克把舱门给杰克看，杰克认为舱门应该被打开来。尽管没人跟他说过，沃特也警告洛克不要打开舱门。凯特威胁索耶她会取得他筏子上的位置。麦可被下毒后，他把索耶剔出了他在筏子上的位置。索耶向大家公布凯特是飞机上的那个通缉犯。沃特向麦可承认防火烧筏，虽然后来麦可说他们可以留在岛上，沃特也依然坚持要离开。在回叙里，凯特回家探望生重病的母亲，遇到了她的前男友Tom Brennan。只因Tom的帮助，凯特才能单独和母亲相处，而母亲见到她时却不停尖叫。她和Tom尝试逃跑，但Tom在意外中身亡，而凯特则逃脱了。

卢梭来到海滩，警告所有人“其他人”要来了，也说出了更多她自己的故事。她十六年前来到荒岛时正怀孕中，而一根黑烟柱告示著其他人的来临，他们来了并夺取了她的婴孩，而那女婴从此未被见过。不久后那黑烟柱出现了，杰克、洛克和萨伊德便把舱口的事告诉了卢梭：他们需要打开它，或许使用炸药。卢梭把他们带到了“黑岩”处取出炸药。杰克、洛克、凯特、赫利、阿玆特和卢梭到达那里，一艘巨大的奴隶船搁浅在陆地上。同时，查理在收集各人的信息并放在一个瓶子里带到木筏上去。回叙里，几个生还者出现在起飞前的时间里。

卢梭离开了“黑岩”，而阿玆特却在处理炸药时炸死了。他们遇上了那只怪物——其实是一团黑烟。卢梭偷去了克莱尔的婴儿——艾润。萨伊德推断卢梭或者想用艾润和其他人交换她自己的小孩。查理和萨伊德向黑烟柱进发，而途中，他们经过了那架走私毒品的飞机，而萨伊德就揭发了当中藏满了海洛因，查理带上了一些。当他们到达了烟柱的时候，那里并没有其他人，只有火堆、卢梭和艾润。她还回了艾润并说她曾听到其他人说他们要“那男孩”。筏子上，他们遇到了一艘小艇。而那小艇却属于其他人并要求交出沃特。索耶被射伤，沃特被抢走。丢出的炸弹损坏了木筏。同时，杰克、凯特、洛克和赫利炸开了舱门，下面是一个很深的洞，旁边有一天断开的梯子。回叙描述生还者们在机场和登机时的情景。

杰克、凯特和洛克爬进了舱口，并找到了在里面生活的德斯蒙德。香农在森林中看见了浑身湿透的沃特。而在回叙中，杰克为他后来的妻子做手术，中途遇上了德斯蒙德，得到了他的鼓励。

麦可、真秀和索耶漂到了另一个海滩上，但是遇到了更多他们认为是“其他人”的人。在舱口里，德斯蒙德命令洛克必须把赫利被诅咒的数字定时输进一部电脑里。回叙描述把他两岁沃特的抚养权让给了沃特的妈妈。

杰克和洛克发现那个舱口其实是一个1980年代用来控制电磁铁的工作站，并由科学研究队达摩计划建造。麦可、索耶和真秀发觉原来他们被生还的机尾乘客挟持着。回叙描述洛克在他父亲和海伦两者的关系上挣扎，而海伦曾经帮他解决他父亲的事情。

飞机尾部生还者把麦可、索耶和真秀带进了一个荒废的达摩工作站。赫利被委派作为达摩工作站里食物的管理员。赫利回忆起他在赢得乐透后，他最好的朋友离开了他。

麦可出发寻找沃特，而真秀和伊高先生随后跟着他，但是途中见到了“其他人”。善华担心着她丈夫的安危，同时她也找回了丢失的结婚戒指。回叙中，描述著善华和真秀在第一次见面之前的生活。

香农相信沃特就在这个岛上，并且准备出发寻找他。索耶濒临死亡，因此安娜·露西亚和其他机尾生还者一起把他送回他的营地去。安娜·露西亚把香农当成是“其他人”，并不小心一枪射死了她。香农回忆著父亲去世后的一连串事件。

镜头描述著飞机尾部生还者在刚刚坠机后的事。在之后的几晚，“其他人”不断进入他们的营地并掳走许多生还者。

伊高把索耶带到了舱口里进行救治。两队生还者在飞机前部的营地中重新组合了起来，露丝也见到了她一直认为生还的丈夫。回叙中，安娜·露西亚作为一个警官时残忍地杀死了一个男人，而这人曾经杀死她肚子里的小孩。

凯特向受伤的索耶表白了。洛克和伊高先生一起观看后来找到的另一卷影带，并且被警告不要斗胆用舱口里的电脑和外界联络，麦可却用电脑和他认为是沃特的人交谈了几句。回叙显示凯特因炸死她的父亲而被通缉。

查理带伊高先生到了那架毒品走私犯的飞机。伊高在飞机里找到了他弟弟的尸体。查理偷偷地拿了几个装着海洛因的圣母像，而克莱尔知道后对查理失去了信心。回叙里，伊高先生曾是尼日尼亚的一名贩毒地主，并一次意外使当牧师的弟弟被杀和带上了飞机，伊高先生则因此代替了他的位置。

麦可为了寻找儿子沃特儿离开了那队生还者。杰克、洛克和索耶跟踪他却在森林里遇到了“其他人”。在回叙里面，杰克的妻子离开了他，跟了另一个男人生活。

查理梦见艾伦的生命有危险，并认为克莱尔的婴儿艾伦需要接受洗礼。克莱尔对查理的行为表示厌恶，而洛克就把所有装着海洛因的圣母像搬到了舱口里面。回忆中，查理曾风光一时的乐队开始没落，并努力地尝试重获过去的威名。

善华被袭击后，杰克、洛克、凯特和安娜·露西亚对枪械管理感到紧张。真相是：索耶和查理用袭击善华一事来欺骗大家，索耶想管理所有枪械，而查理则是对洛克的进行报复。回叙里面，索耶被迫欺骗一个他渐渐产生感情的女人。

卢梭带萨伊德到了一个她认为是“其他人”一员的人，萨伊德也坚决认为那人是“其他人”之一，并且开始严刑拷问那个自称为“亨利·盖尔”的人。回忆里显示出萨伊德第一次折磨拷问犯人的时候。

有一次艾伦病了，克莱尔、凯特和卢梭一起到了克莱尔曾经被挟持的地方，那是一个荒废了的达摩医药站，因此她们几个都希望找到一些药物。杰克坚决反对折磨任何人，而且觉得那个人不是“其他人”；洛克却赞成萨伊德的做法，因此他俩争论了起来。克莱尔渐渐地记起了伊森抓住她，而卢梭和她女儿（“其他人”之一）一同救出自己的事情。

安娜·露西亚、萨伊德和查理出发寻找亨利提起的乘坐来到岛上的热气球。另一方面，善华验出自己怀孕了。回叙中，善华发觉真秀是不育的。

舱口莫名其妙地困住了洛克并压伤了他的脚，因此洛克被迫要让亨利从通风管爬过障碍并把那些数字输进电脑。安娜·露西亚、萨伊德和查理回来了，尽管他们找到了热气球，但是种种迹象显示所谓的“亨利·盖尔”是一个谎话，实际上那人就是“其他人”的一员。回忆里面，洛克对海伦的求婚被拒绝了，而海伦说除非他放开他父亲对他造成的痛苦，否则他俩不会结婚。

赫利追着他以前幻想出来的好朋友到了丛林里，另一方面他和莉比的感情慢慢地建立了起来。洛克开始质疑自己在舱口做的重复工作，因为亨利后来说他爬出去后根本没有输入任何东西到电脑里面。赫利回忆起他从前在一家精神康复院的时候。同时也显示，莉比那时也在同一家康复院里，但是赫利并不察觉。

柏纳组织了一队人，准备在海滩上拼出一个大大的S.O.S.求救信号，不过当露丝告诉他这个岛治好了她的癌症，而她自己并不想离去的时候，柏纳停止了他的工作。浪漫的火花在杰克和凯特之间擦出，同时洛克也渐渐对这个荒岛失去信心。回叙中，露丝和柏纳在澳洲度过他们的蜜月。

麦可突然归来，并说“其他人”事实上没有任何抵抗能力。安娜·露西亚努力从亨利套出真相。赫利和莉比约会，为莉比带来了惊喜。回到舱口里，麦可枪杀了安娜·露西亚和莉比，并且救出了亨利。回忆里，安娜·露西亚为杰克的爸爸做保镖，跟他来到了澳洲。

伊高先生和洛克发现了一个新的达摩工作站，作用是监视其他的工作站。同时在一个荧屏中，他们见到了一个从未去过的地方，里面住了一个遮著一只眼睛的人。回叙里面，伊高以神父的身份到了澳洲，调查一宗死而复生的奇迹事件。

麦可说服杰克、凯特、索耶和赫利帮他一起去拯救沃特。同时，海滩上举行了安娜·露西亚和莉比两个葬礼，萨伊德告诉杰克他担心麦可与“其他人”达成了一些协议。回叙显示出麦可被“其他人”挟持的一段时间，并且同意以放出亨利、带来杰克、凯特、索耶和赫利，来换回儿子沃特。

麦可领着杰克、凯特、索耶和赫利到了“其他人”的地方。出现为“其他人”领导的亨利命令放走赫利，并把杰克、凯特和索耶关起来，再让麦可乘船带沃特离开这个岛。德斯蒙德回来了，并且得知他因为太迟输入号码而使海洋航空公司815航班失控坠毁了。洛克尝试不输入号码，但是自己、伊高先生和德斯蒙德却被困在舱口里了，最后舱口内爆了。回忆里，德斯蒙德在一次环球帆船赛中遇到风暴来到了岛上。他后来意外地杀死了凯尔分——把他带到舱口里的人。

麦可领着杰克、凯特、索耶和赫利到了“其他人”的地方。出现为“其他人”领导的亨利命令放走赫利，并把杰克、凯特和索耶关起来，再让麦可乘船带沃特离开这个岛。德斯蒙德回来了，并且得知他因为太迟输入号码而使海洋航空公司815航班失控坠毁了。洛克尝试不输入号码，但是自己、伊高先生和德斯蒙德却被困在舱口里了，最后舱口内爆了。回忆里，德斯蒙德在一次环球帆船赛中遇到风暴来到了岛上。他后来意外地杀死了凯尔分——把他带到舱口里的人。

杰克被囚禁在达摩计划的水底工作站Hydra里，这时一个自称称朱丽叶的女人出现，试图与他沟通。凯特和索耶被关在附近的笼子中。索耶尝试和另一个叫Karl的小伙子（“其他人”一员）一起逃跑，却不幸又被抓回来了。“亨利·盖尔”的真名叫班，并且是这群“其他人”的领导。回忆里面，杰克努力找出谁抢走了他的妻子萨拉，导致了他们婚姻的失败。杰克怀疑他自己的爸爸，因此在戒酒中心的聚会上打了他一顿。杰克被捕，而他的太太保释他。

班和杰克作出了交易：只要杰克合作，班就会放他离开荒岛。“其他人”要凯特和索耶敲碎石块，而他俩那时才发现他们一直都在闭路电视里受到班的监视。在帆船上，善华、真秀和萨伊德被“其他人”暗中袭击。善华一枪射穿了“其他人”的一员Colleen，而帆船则后来被“其他人”拿去。最后他们三个人走回到了生还者营地。回忆中显示出善华的父亲发现了她和Jae Lee的不寻常关系，并命令真秀杀了Jae。然而真秀只是威胁了他，尽管最后Jae还是跳楼自杀了。

洛克、戴斯蒙德和伊高在舱口内爆之后并没有死。洛克在暂时说不了声的同时，却仿佛看到了布恩，于是因为某些相关的原因和查理一同从一头北极熊的洞穴中救出了伊高。赫利逐渐发觉在舱口内爆后，戴斯蒙德有了“记得”未来事件的能力。回忆里面，洛克是一个大麻种植场社区的一分子，有一次他意外地从外带进了一个假装迷路的警察。

可琳因枪伤去世，她的丈夫皮克特以殴打索耶泄愤。索耶受班的欺骗，以为一个心脏起搏器已经被植入自己的体内，只要自己的心跳超过每分钟140次，心脏便会爆炸。班后来告诉索耶他尝试逃走是没用的，因为他们根本不在生还者营地的那个岛上，而是旁边的另一个小岛。回忆中，索耶因欺骗罪入狱，却发觉自己有一个女儿。在假装对女儿毫不经意的同时，他也给了女儿一大笔金钱。

伊高跟着一个似乎是他死去的弟弟的人走进了丛林，却发觉那是只烟雾怪兽，正准备要杀了伊高。杰克知道了自己被“其他人”捉去，是为了要帮班做脊椎肿瘤切除手术。茱莉叶倒戈相向，并和杰克一起对抗班，还设计了一个计划，要杰克在做手术时假装意外杀死班。在回忆中，伊高的弟弟死去之后，他成为了一名牧师，而且为了保护自己的小镇而杀死了几个威胁他安全的人。

凯特和索耶在笼子里做爱，表示出大家互相的爱情。杰克中止了班的脊椎手术，并且威胁“其他人”要是不给凯特和索耶时间逃走，他就杀了班，这时火冒三丈的Pickett差点杀死索耶。回忆中，凯特千方百计想过正常的生活，却最终还是在对丈夫自首之后逃走了。

“其他人”之一的青年艾莉克斯提供了一只独木舟给凯特和索耶，让他们回到自己所住的岛屿上；却要求他们先让她救出自己的男朋友，因为他被关在一间房间里被迫开影片洗脑。茱莉叶从后杀死了用枪指著凯特和索耶的Pickett,另一方面杰克完成了班的手术。回忆里描写，飞机失事之前三年，茱莉叶一直是一位不孕症医生，并且曾是自己不育的妹妹怀孕。Mittelos Bioscience访问茱莉叶。

查理和赫利尝试灌醉戴斯蒙德，好套出他能预见未来的原因。回忆描述在舱口内爆之后所发生在戴斯蒙德身上的事。他回到了过去，重新过了一次来荒岛之前和Penny一起的生活。同时他在买戒指时从一位能预知未来的店主学到了宇宙有“路经修正”的能力，世上所有的事件如果要发生，就终会发生，谁也阻止不了。他忽然又回到了岛上，从此有了能看到未来片断的能力。他沿用学到的道理，预言查理被上天选中，很快便会死。

茱莉叶因谋杀Pickett而接受审讯。有了杰克和班的帮助，茱莉叶才没有被判死刑。“其他人”和杰克回到了“其他人”在生还者营地所处的岛屿上落后的住所。回忆中，描述杰克在一次奇异的泰国旅行中认识了一个泰国女人，并得到了他肩膀上的纹身。

凯特和索耶回到了海滩上。赫利在森林里找到了一辆被荒废的破旧小货车，并且和查理、索耶和真秀一起驾驶它。凯特、萨伊德和洛克出发营救杰克。回忆里，赫利的父亲在赫利赢得乐透头奖之后回家了，因此被赫利认为是为他的奖金而来。

洛克、萨伊德和凯特调查一个达摩通讯站，并遇到了居住其中的Mikhail。离开时，洛克把这个工作站炸了。索耶为了取回自己的财物而和赫利进行了一场乒乓球赛，然而他输了，因此需要遵守约定：一个星期之内不准帮人们改别名。回忆里面，萨伊德在巴黎碰上了一个他曾经拷问过的犯人。

克莱尔得知了德斯蒙德能预知未来的秘密，并且把一条求救纸条绑在一只候鸟脚上再放走它，希望有一日会有人发现。洛克、萨伊德和凯特在拯救杰克的路上被一条保护“其他人”住处的超声波防线挡住了。Mikhail被洛克迫使穿过防线，超声波导致他口吐白沫身亡。大家以从上饶过探测器成功穿过防线。回忆中，克莱尔在一次车祸之后进了医院，遇到了自己从未见过的父亲——原来她的父亲就是杰克的父亲。

洛克、萨伊德和凯特第一次来到“其他人”住的地方，却发现杰克在那里生活得很高兴。感情日渐加深的杰克和茱莉叶跟班定下协议，要班用“其他人”的一艘潜水艇运走他们，然而洛克一手炸了潜水艇，使计划泡汤。班告诉洛克，洛克的父亲已经被他关起来了。回忆中，洛克的父亲把他从窗户推了出去，使洛克下身瘫痪。

查理告诉善华他和索耶是在森林里绑架她的幕后策划者。生还者们发现妮姬和保罗倒在地上。回忆里，妮姬和保罗为一些从一位百万富翁television executive那里骗回来的钻石而争执。回到荒岛上，妮姬在保罗身上释放了一只剧毒蜘蛛，保罗即时瘫痪了；那蜘蛛引来了许多蜘蛛，也把妮姬瘫痪了，他们双双被困八小时。后来，生还者们并没有察觉他们被毒液瘫痪，因此活活埋了他们。

“其他人”和洛克一起离开了“其他人”的住处。Hurley cons Sawyer into making amends with his fellow castaways。回忆里，凯特用尽办法，最终和抛弃她的母亲见面了。

杰克、萨伊德、凯特和茱莉叶从“其他人”的营地回来了，因为杰克一直信任著茱莉叶，尽管其他生还者对他的举动深表怀疑。一种奇怪的病出现在克莱尔身上，是“其他人”在他身上植入的物体引起的，茱莉叶却为她十分担心。回忆描述茱莉叶在荒岛上的生活。茱莉叶被迫住在岛上，眼睁睁看着一个个在岛上怀孕的人莫名其妙地死去而无能为力阻止。回忆又显示茱莉叶和班联合计划阴谋，让茱莉叶潜入生还者们作内奸。

为关于未来的“记忆”驱使，德斯蒙德说服查理、赫利和真秀徒步穿越森林，使他们得以发现刚刚用降落伞着陆的娜欧米。在看到杰克和茱莉叶单独相处后，凯特的爱情目标转向了索耶。回忆之中，显示出德斯蒙德曾是一位修道士，并描述他如何遇上Penny。

善华得知在岛上怀孕的女人都会在分娩前死去，因此要求茱莉叶检验一下她是否在岛上怀孕，茱莉叶于是把她带到了一个达摩医疗站。善华离开后，茱莉叶向班报告了情况。德斯蒙德在森林里碰到了前段时间竟然没有死的Mikhail，并让他救救娜欧米。回忆显示善华被真秀的生母敲诈，然而早前真秀告诉她母亲已去世。

回忆里，洛克的父亲被“其他人”关起来了，而他则正常地和“其他人”生活。回到当前，洛克说服了索耶到“黑岩”看看洛克的爸爸。索耶后来以枪杀了洛克的爸爸，因为他就是“索耶”这个假名的由来，也就是杀死父母的人。

洛克回到了“其他人”那里，而班很不情愿地带洛克去见“其他人”神秘的真正领袖Jacob。洛克并没有看见他，但能听见他，尽管班却聼不到，因此才在洛克独自上打了一枪。自从发现茱莉叶是内奸之后，生还者们对杰克越来越不信任，但是茱莉叶却表明她和杰克已经一起对抗“其他人”了。回忆里面，还是个小男孩的班第一次来到荒岛上，成为达摩计划的一分子。班和“其他人”（at least one of whom, Richard Alpert, does not age in the next thirty years）计划阴谋，杀死了大部分的达摩计划成员。

杰克得知了“其他人”要在晚上伏击并虏走孕妇的计划，因此决定组织人们以炸药抵抗。为了使萨伊德能用娜欧米的卫星电话发出求救信号，查理必须游到一个阻断所有信号的水底达摩工作站，关掉装置。而根据德斯蒙德的预感，查理将会在这个任务中溺水而死，却可以让他心爱的克莱尔上救援直升机，因此查理写下了他平生最有意义的五个时刻，最为队自己对这个世界的告别。

杰克以炸药杀死“其他人”的计划弄巧成拙，而萨伊德、真秀和柏纳则在海滩上被“其他人”劫持作人质了。由卢梭带领的生还者们向一座无线电发射台进发，准备关掉卢梭16年前发射的信号。娜欧米尝试联系她所属的船只，却被洛克从后用刀袭击；而班也赞成这么做，并坚决认为生还者们现在的行动是错误之举。查理和德斯蒙德在水下的达摩工作站里，而查理在刚和德斯蒙德女友Penny Widmore取得联系之后，Mikhail便炸破的窗户，查理因此淹死，应验了德斯蒙德的预言。另一方面，索耶、茱莉叶和赫利救出了海滩上的人质。“前叙”代替了之前的回叙和回忆，这集第一次的前叙里，杰克获救之后过着痛苦的生活。

杰克以炸药杀死“其他人”的计划弄巧成拙，而萨伊德、真秀和柏纳则在海滩上被“其他人”劫持作人质了。由卢梭带领的生还者们向一座无线电发射台进发，准备关掉卢梭16年前发射的信号。娜欧米尝试联系她所属的船只，却被洛克从后用刀袭击；而班也赞成这么做，并坚决认为生还者们现在的行动是错误之举。查理和德斯蒙德在水下的达摩工作站里，而查理在刚和德斯蒙德女友Penny Widmore取得联系之后，Mikhail便炸破的窗户，查理因此淹死，应验了德斯蒙德的预言。另一方面，索耶、茱莉叶和赫利救出了海滩上的人质。“前叙”代替了之前的回叙和回忆，这集第一次的前叙里，杰克获救之后过着痛苦的生活。

介绍了氢弹爆炸的两个结果。815航班安全降落在洛杉矶国际机场，凯特从警察局逃脱，杰克得知他父亲的尸体在途中丢失。

雅各死后，幸存者们回到了今天；朱丽叶死了，赛义德被带到别人的神庙后复活了。此外，这名扮演骆家辉的黑衣男子被证实是烟雾怪物，并在316航班上杀死了几名伊拉娜的团队成员。

当索耶从庙里逃跑时，凯特和金被派去把他带回来。同时，其他人确定赛义德被感染并试图毒死他。在侧面的闪光中，凯特仍然在逃，当克莱尔分娩时，她带她去了医院。

在岛上，黑衣人试图招募索耶离开岛，而真正的洛克则举行了即兴葬礼。从侧面看，洛克被解雇，成为了一名代课老师。

在雅各布的命令下，赫尔利把杰克带到一座灯塔前。与此同时，克莱尔询问了她在照顾受伤的金时抓到的另一个人。从侧面看，杰克是一个试图与儿子建立联系的单身父亲。

在招募赛义德加入他的事业后，这位黑衣人向其他人发出了最后通牒：要么加入他，要么死亡。与此同时，凯特与克莱尔重聚。在这一瞬间，赛义德帮助他的兄弟，他欠了一个高利贷者的债。

伊拉娜发现本杀了雅各布，所以她计划杀了他。与此同时，杰克、赫尔利和自杀的理查德参观了黑岩。在这一瞬间，本，一名高中教师，试图勒索学校的校长。

黑衣人派索耶去海德拉岛执行侦察任务，在那里他发现查尔斯·维德莫尔已经和一队科学家回到了岛上。在侧面的闪光中，索耶是一个孤独的警察，他仍在寻找原始的索耶。

理查德·阿尔伯特的背景故事如下：1867年，他作为奴隶被带到黑岩岛上。他与雅各布达成协议，作为他的代表，以换取永生。如今，赫尔利说服他帮助候选人取代雅各布，阻止黑衣人离开该岛。

在金被韦德摩尔的团队绑架并带到九头蛇岛后，黑衣人与韦德摩尔对峙。在主岛上，孙失去了说英语的能力。在侧面闪光中，孙和金在未能完成孙父亲的交易后被绑架。

在岛上，威德莫尔让德斯蒙德接受大量电磁能量的实验。在《侧身闪光》中，德斯蒙德在查理的帮助下，开始在最初的时间线中想象自己的生活。

为了防止更多的生命损失，赫尔利带领其他幸存者与黑衣人交谈。在侧面闪光中，赫尔利与利比会面，而德斯蒙德继续他的任务，让大洋 815乘客了解他们在岛上的生活。

幸存者分成两组；一个由索耶领导，另一个由黑衣人领导。索耶的团队前往九头蛇岛，在孙和金重聚后，他们被维德莫尔的船员抓获。在侧面的闪光中，大洋 815的乘客继续相互交叉。

在剩下的幸存者重新团聚后，索耶和杰克策划了一个转移黑衣人注意力的计划，并在威德莫尔的潜艇上离开小岛，但灾难性的后果等待着他们。在侧面闪光中，杰克调查了洛克瘫痪的原因并提供了治疗。

据透露，雅各布和那个黑衣人是孪生兄弟。他们由一位负责保护该岛的神秘女子抚养长大。为了报复他们的养母（杀死了他们的亲生母亲）的谋杀，雅各布在成为岛上的守护者后，将他的兄弟扔进了电磁源，从而将黑衣人变成了烟雾怪物。

本在接受了穿黑衣服的人的帮助请求后，终于向维德莫尔报仇。雅各布解释了候选人的目的，杰克自愿代替他。对德斯蒙德的搜寻显示，他已获救，黑衣人计划利用他摧毁该岛。在侧面的闪光中，每个人都会在去音乐会的路上结束。

出于不同的原因，杰克和黑衣人都使用德斯蒙德来熄灭岛中心的灯光。岛开始瓦解，但黑衣人也成了凡人。穿着黑衣的男子仍然不顾一切地想逃跑，他与杰克搏斗，并致命地伤害了杰克，但在凯特的帮助下，杰克杀死了他。杰克意识到了自己的命运，牺牲了自己，重新点燃了岛上的心脏，这样他的朋友们就可以乘Ajira飞机逃走了。赫尔利接替杰克成为岛上的保护者，并任命本为新顾问。侧面的闪光被揭示为主人公的一种边缘，或保持模式，他们居住在那里直到接受他们的生与死，然后能够一起“放手”和“前进”。