大沼水坝附近出现谜样巨大生物，为保护附近居民安全我梦独自展开调查。我梦找到未来，询问谜样生物的事情，未来却道出惊天秘密。巨大生物居然是过去的生物的残念物化出实体。XIG该如何应对这“鬼魂”，我梦又在计划着什么……

XIG中警报响起，原来是木星轨道上的特罗亚小行星发生了巨大爆炸。我梦调查后发现引起大爆炸竟是物质和反物质的碰撞造成，这将对地球是个巨大威胁。就在此时，木星轨道上出现的巨大反物质将在1周后抵达地球轨道。我梦该如何解决这地球的巨大威胁……

天空出现奇怪的积雨云，太过接近时间也被搅乱。米田执意向前冲，于与怪兽同归于尽，我梦为阻止米只身闯进能源体中。XIG调查出来这个怪兽居然能穿越时空。我梦该如何对抗……

炼金之星找到了一个叫做M91的恒星系，这个恒星系居然就是根源性灭亡体的母星。吉欧基地立刻准备进行主动进攻，意图摧毁根源性灭亡体。我梦开始不安，请求上面暂缓这次进攻行动。为什么我梦这么强烈要求取消攻击，这中间还有着什么转机……