Abalado pela explosão do Jipe, o 16º aniversário de John o força a confrontar a realidade de seu destino sozinho. Enquanto isso, o agente Ellison encara sua fé e os federais apóso massacre de Cromartee, e uma nova personagem é introduzida, Catherine Weaver, que é a CEO de uma corporação high-tech e um T-1001 disfarçado, mandado para garantir a criação da Skynet. 

Sarah, Derek e Cameron invetigam uma planta de energia nuclear, e John faz uma nova amiga. Enquanto isso, Catherine Weaver continua com seu novo projeto. 

John e Derek protejem um futuro membro da resistência em uma academia militar. Weaver dá à Ellison seu primeira missão.

Cameron perde sua memória temporariamente e acaba descobrindo memórias antigas. Ellison descobre informações sobre Catherine Weaver.

Cromartie sequestra a esposa de Charley, e Sarah e Derek tentam resgatá-la, enquanto John se encontra preso entre Cameron e Riley.

Os connors são roubados os deixando em alerta máximo, um exterminador chega muito proximo a jonh enquanto outro aterroriza o agente elison.

Sarah e Cameron tentam salvar uma família cujo destino está ligado com o de Derek no futuro. Jesse luta por sua vida.

Sarah, John e Cameron procuram por um outro nome em sua lista. Enquanto isso, Derek recebe um visitante de seu passado.

Sarah têm experiências de déjà vu, quando ela tem pesadelos perturbadores, o que significa problemas para Sarah e John. Derek e Jesse procuram por um colaborador da Skynet. 

Sarah se encontra com o Turk. Jesse enfrenta alguns problemas em seus planos. Ellison tem uma reunião surpresa com alguém poderoso através de Weaver.

John e Riley enfrentam consequencias fatais em sua viagem ao mexico. Sarah finalmente encontra o agente Elison.

Um Exterminador enviado na hora errada provoca resultados catastróficos de mudar a história. 

A obsessão de Sarah continua com os três pontos e a leva a um blogueiro com conhecimentos profundos sobre o símbolo. Enquanto isso, Riley e Cameron se enfrentam.

Sarah ganha força a partir de imagens de Kyle Reese, pai de John, enquanto ela está ferida. Weaver tenta salvar John Henry.

Sarah, John, Cameron e Derek vão em busca de pistas ligadas a uma fábrica que foi demolida. Weaver envia um homem para o mesmo lugar para procurar por sobreviventes.

Sarah é forçada a procurar ajuda pelos seus pesadelos em uma clínica. Ela tenta descobrir o próximo passo da Skynet.

Cameron cria perigo para todos com suas falhas. Riley teme que seu segredo seja descoberto.

Jesse deixa Serrano Point em 2027 para uma nova missão a bordo de um submarino nuclear. Sarah e John suspeitam de Cameron na morte de Riley. Ellison e Weaver tem de jogar um jogo com John Henry para encontrar a desaparecida Savannah.

Sarah esconde John com Charley Dixon, a única pessoa que ela acha que pode confiar. Enquanto isso, Derek se esforça para trabalhar junto com Cameron, e alguém compromete John Henry, colocando os esforços de Catherine Weaver em risco. 

John está um passo mais perto de capturar Weaver enquanto está em sua missão para resgatar o mais recente alvo da Skynet. A reunião de Sarah e Ellison faz uma mudança em seu plano. Weaver descobre o segredo de Ellison.

A missão de Jesse toma um rumo para o pior, o que resulta em conseqüências inesperadas para Sarah, John e Derek. Enquanto isso, Sarah lida com Cameron e John faz uma decisão muito importante. 

Os Connors enfrentam Weaver cara-a-cara em um confronto que mexe com John e muda sua realidade para sempre. Nada mais será o mesmo.