塞伯坦被汽車人和霸天虎的內戰搞得滿目瘡痍。汽車人決定乘坐方舟號離開塞伯坦尋找新能源，霸天虎聞風後，威震天派震盪波留在塞伯坦，其餘霸天虎乘坐報應號追擊。在追擊過程中霸天虎登上方舟號，但飛船不幸發生事故，墜入地球，兩個派別的人都昏迷不醒。四百萬年後，一次火山爆發使飛船重新運作，首先復活了霸天虎一行。紅蜘蛛為了消滅昏迷的汽車人偶然再次觸發了修復系統，汽車人全體復活。擎天柱派探長和飛過山監視霸天虎的行動，因為飛過山的開火使得二人被追殺，探長受傷。威震天為了獲取能量塊前往油井，聞訊的汽車人及時趕到。霸天虎獲得能量塊立刻撤離，汽車人與油井工人落入海中。

汽車人解救了油井的工人，並讓人類斯派克父子加入了汽車人的陣營。斯派克偶然將變成收音機的聲波帶入汽車人基地，獲得了有關地球能量儲存的資料。聲波逃跑過程中機器狗被汽車人所俘。觀看了聲波帶來的資料，威震天決定到水力發電廠獲取能量。霸天虎戰勝汽車人帶着能量塊離開了水力發電廠。威震天又來到了緬甸的紅寶石礦，而汽車人派大黃蜂和斯派克普拉深入礦井安置炸彈。眼看爆炸時間快到，擎天柱和他隨身攜帶的小滾輪前去營救，炸彈正好爆炸。

爆炸並沒有傷害到小滾輪和大黃蜂與斯派克普拉，但霸天虎同樣逃過一劫。探長提出可以利用全息影像哄騙霸天虎並將其一網打盡，並演了一出不小心放走機器狗的戲。機器狗回到霸天虎基地，威震天識破了汽車人的詭計，做了一堆廢料交給汽車人處理，而同時其他霸天虎來到火箭基地獲取了足夠讓霸天虎飛回塞伯坦的能量。汽車人包圍了威震天飛船所在地，但沒能阻止霸天虎登上飛船。擎天柱飛上天阻止飛船但被飛船擊中。幻影隱身進入霸天虎飛船使飛船失控，霸天虎回到塞伯坦的計劃失敗。霸天虎的飛船落入海中，汽車人以為他們已經被消滅。