Agent Mulder och Dana Scully återförenas efter att de särade på sig då Mulder förlovade sig med en programledare. Mulder påstår att nya bevis på bortförande av rymdvarelser är förfalskade.

Panik sprider sig när människor från hela landet plötsligt blir sjuka. Scully söker svar inom sig medan Mulder konfronterar en man som han tror ligger bakom allt. Men när en figur från det förflutna dyker upp verkar det vara nyckeln till deras gåta.