В то время, как Скалли исследует инопланетный артефакт в Африке, Уолтер Скиннер и Майкл Кричго пытаются спасти Малдера, запертого в психиатрической клинике.

Курильщик похищает Малдера из психиатрической клиники, чтобы использовать в своих целях. Скиннер и Скалли с помощью Майкла Кричго пытаются разыскать и спасти Малдера.

Малдер и Скалли ведут дело о похищении маленькой девочки в Сакраменто, штат Калифорния. Несмотря на то, что улики указывают на причастность серийного маньяка, Малдер фанатично верит в версию об инопланетянах. Во время этого расследования он переживает большую личную потерю.

С помощью экстрасенса Гарольда Пиллера агент Малдер приходит к пониманию того, что ему пора прекратить поиски сестры.

Курильщик предлагает Скалли отправиться вместе с ним в путешествие на автомобиле через всю страну для поисков лекарства от всех болезней. Главное его условие - Малдер не должен ничего знать о поездке.

Малдер и Скалли возвращаются на место своего первого расследования, где по рассказам очевидцев упала летающая тарелка. У Скалли ухудшается здоровье и она отстраняется от дела. Оставшийся в одиночестве Малдер еще не подозревает, что именно он является главной целью для похищения инопланетянами.