Scully FBI-os karrierje is veszélybe kerül, mivel Mulder még mindig nem került elő és többen is meg akarják kapni az ellopott iratokat. Közben a Navajok egy barlangban megtalálják Mulder testét és egy ősrégi szertartással életre keltik a lelkét.

Mulder is rájön, hogy Skinner-nél van a keresett szalag. Scully és Mulder újra együtt, egy rejtett pincébe mennek egy bánya mélyére, ahol egy igencsak alaposan kidolgozott rendszerre bukkannak, amely orvosi esetek jegyzékét tartalmazza. A rendszer szerint valószínűleg nem Mulder huga volt az első kiválasztott, akit idegenek raboltak el.

Mulder elragadtatva néz végig egy postán rendelt videófilmet, egy állítólagos földönkívüli lény boncolásáról. A felvételeken egy japán orvoscsoport végzi a boncolást. A kazettának azzal van vége, hogy fegyveres katonák jelennek meg a műtőben.

X elmondja Scullynak, hogy a nyakából kioperált chip a kulcs mindahhoz, amire választ keres. Mulder továbbra is kitart az elmélete mellett, hogy Zama az emberek és földönkívüliek keresztezésével létrehozott egy új lényt, amely ellenáll a sugárzásnak és a biológiai fegyvereknek is.

Egy elveszett második világháborús harci gép után kutató francia mentőhajó egy idegen létformára bukkan, amely fekete olaj formájában jelenik meg, és hatalmas távokat képes megtenni. Mulder Hong Kongba utazik, hogy megtalálja a brókert, aki eladta az információt a franciáknak.

Mulder nem tudja, hogy Kryzek testét átvette egy idegen, és rá akarja venni, hogy szerezze vissza az MJ dokumentumokat tartalmazó szalagot. Közben, Skinner halála olyan bizonyítékokra derít fényt, amelyek elvezethetik Scully-t húga gyilkosához.

Miután egy férfi megöl három embert és a saját feleségét, mert összetévesztette őket egy kegyetlen közelkeleti diktátorral, Scully és Mulder különleges jelekre bukkannak a televízióban, amelyek valóra váltják az emberek legnagyobb félelmeit bármilyen formában.

Egy forgalmas arlingtoni gyorsétkezdében Galen, a zavarodott férfi, lövöldözni kezd a vendégekre. Egy rendőr viszonozza a tüzet és súlyosan megsebesíti Galent. Ekkor egy kedves mosolyú ember lép elő és tenyerét Galen sérülésére helyezi. hamarosan a seb begyógyul. Mire Mulder és Scully a helyszínre érkeznek teljes a káosz, mert a mentősök egyetlen sebesültet sem találnak, mindenki meggyógyult. Tovább nehezíti a helyzetet, hogy a titokzatos jótevő nyomtalanul eltűnt a színhelyről.