中學女生阿籬被送回戰國時代，並在此喚醒被封印多年的半妖犬夜叉。

阿籬得到控制犬夜叉的能力之後，得知自己的前世可能是楓的姊姊桔梗，就是當年封印犬夜叉的人。

阿籬和犬夜叉得藉助彼此的能力，來蒐集四魂之玉散落各地的碎片，但兩人卻處不來。

回到現代，阿籬在家放鬆休息時，犬夜叉卻找上門來，兩人於是一同回到過去，尋找結羅的下落。

犬夜叉同父異母的哥哥殺生丸現身，尋找狗妖父親的墳墓。阿籬得知犬夜叉的過去。

阿籬雖然幫忙出手攔阻，殺生丸依然找到了犬夜叉之父的墳墓，原來這裡有他渴望得到的一把刀刃。

阿籬從祭壇成功拔出鐵碎牙這把妖刀。殺生丸試圖殺掉她，因此惹火了犬夜叉，引爆兄弟間的對決。

犬夜叉和阿籬遇見年輕的武士信長，他的領主被一隻蟾蜍妖附身。大夥動身拯救一位公主。

犬夜叉與阿籬在旅途中，遇見了小狐妖七寶。他為了替慘遭殺害的父親報仇，而偷走一片四魂之玉。

犬夜叉和飛天決鬥，七寶則試著使出魔法，救阿籬逃離滿天的魔掌，但要打敗雷獸兄弟可沒那麼簡單。

阿籬回到現代時，四魂之玉的力量，讓一副古老的能面具復活，並攻擊她的爺爺。

犬夜叉撞見崇妖，這位仁慈的妖怪負責引領孩童的靈魂。阿籬則遇見小女孩真由的靈魂。

犬夜叉和阿籬救了名叫小薺的女孩後，一同在一間神社過夜，也進一步瞭解犬夜叉變身的始末。

犬夜叉等人碰上盜取桔梗之墓的鬼女裏陶，當初就是桔梗這名巫女封印了犬夜叉。他則下定決心不讓鬼婆得逞。

裏陶為了讓桔梗起死回生，綁架了阿籬。桔梗復活之後，在盛怒之下立刻出手，打算殺掉犬夜叉。

花心的年輕法師彌勒鍥而不捨地蒐集四魂之玉的碎片。他偷走阿籬的碎片後，犬夜叉一路跟蹤他，要把東西拿回來。

藝術家地獄畫師夢想靠著四魂之玉的一塊碎片，來控制鬼怪大軍，這下得靠犬夜叉和其他人來阻止他了。

奈落給殺生丸一截嵌入四魂之玉碎片的人類手臂，讓對方用以設法再次得到鐵碎牙。

犬夜叉與殺生丸對戰之際，阿籬卻受傷了。犬夜叉得知奈落的計畫後，深怕她會丟掉性命。

楓帶著犬夜叉和彌勒來到附近的一處洞穴，這裡原來跟她與桔梗的過去有關。另一方面，阿籬努力重新適應尋常的生活。

犬夜叉和狼野幹依舊纏鬥不休。阿籬中斷她與北條的約會，返回神社後，感應到四魂之玉的存在。

顯然有人用計讓桔梗復活，她現在成了村裡的巫女。一名雲遊的法師察覺她頗有蹊蹺。

犬夜叉到處尋找桔梗，卻被阿籬先找到了。桔梗囚禁了阿籬，她試著向桔梗解釋究竟發生了什麼事，桔梗卻聽不進去。

驅魔師珊瑚和父親及弟弟琥珀受邀來到人見城堡，卻讓村莊因此毫無防備。

奈落想置犬夜叉於死地，於是精心策劃，讓珊瑚深信犬夜叉與她為敵。珊瑚中計，一心想找犬夜叉報仇。

犬夜叉和朋友們為了安葬死者而耽擱時，珊瑚透露四魂之玉不為人知的由來：巫女翠子自己的靈魂。

犬夜叉和朋友們發現一座拿小孩獻祭當地水神的村莊，還碰見需要幫助的小男孩太郎丸。