天真楼医院新来了一位从美国堪萨斯州回来的医生——石川玄。在报到的当天就遇上了紧急情况，先是住院患者柏木失踪，然后，又有两名急诊病患需要同时动手术，但值班的峰春美只是一名实习医生，外科部长中川淳一被欧特医疗器械公司的星野邀去应酬，唯一一名仍留在医院的外科医生司马江太郎则以“我已经下班了”为由拒绝手术，并说出“已经没救的病人就让他死吧”这样的话来。无奈中，石川只得将两个手术同时进行。这时，院长特意打来电话，说议员的儿子遭遇车祸，需要抢救。就在石川分身无术的时候，司马接下了这个手术。

外科接到一名心肌梗塞的危重病人，石川和司马在这个病人的治疗方案上起了争执。石川主张保守治疗，而司马却认为保守治疗相当于让病人等死，主张即使只有10%的成功可能也要冒险为患者手术。会议通过了石川的意见，司马却利用星野买通麻醉师，想要擅自进行手术。石川发觉后，两人在手术室吵起来。中川部长改变主意，决定让司马冒险做手术。手术进行顺利，然而患者却在最后关头由于生命指数过低而去世。下班后，司马一个人默默站在盖着白布的患者遗体身边，这时，被护士忘记关上的心电图忽然起了反应，司马思索片刻，上前关掉了仪器。

　司马关掉心电图的事情被峰医生说了出去。外科决定成立“惩罚委员会”对司马做出处罚。石川和峰请来麻醉师，也是司马前女友的大榇泽子为此事作证，并在医院社工稻村宽的提示下找到了患者当天的心电图记录。惩罚委员会上，中川部长意欲袒护司马，但司马却在充足的证据下不得不承认自己关掉已经起反应的心电图仪器的事实。就在这时，护士惠美却忽然站了出来，说心电图是她关掉的……

医院送来了一位长有腹部大动脉瘤的患者，外科主任平贺认为情况十分危险，需要马上手术，否则倘若动脉瘤破裂患者随时有死亡的危险。但是，患者本人是一家公司的社长，而当天晚上必须出席一个关系到公司存亡的会议。送社长来到医院的下属请求院方向患者本人隐瞒真相，延迟手术。司马收下贿赂，答应了请求，并找来一张腰椎间盘突出的X光片用来搪塞。石川发现了X光片的蹊跷，经过调查，发现司马做了手脚。他来到患者面前将事情说了出来，但患者本人却在司马“我一定会救活你”的保证下决定出席当晚的会议。患者在会议结束后晕倒，一直守在现场的峰将患者火速送到医院。中川部长决定将这个手术交给司马和石川两人一起完成，手术过程中，司马却因嫌石川动作太慢而故意用手术刀划破了石川的手。

　中川部长欲提拔石川为参事，司马对此感到不忿。居住密集区域发生瓦斯爆炸，多名患者被送到医院来，石川指挥医生们分别对患者进行处理。患者之一的上野女士被送到医院来的时候由于精神很好，被石川忽视，在诊疗室里等了很长时间，当石川治疗完毕其他患者的时候，司马发现上野倒在走廊里。CT检查显示上野的伤情是骨盆骨折导致大动脉损伤，已经无法挽救，但司马决定对其进行手术。上野不治身亡，其子在司马的电话联系下在大雨中赶到医院。石川对此愧疚万分……

　由于石川的工作失误，中川改提司马为参事，并升为外科主任，将平贺降为副主任。平贺对此深感妒忌。石川为自己的失误一直精神不振，稻村建议他趁休假的时候做个身体检查。这时候，医院住进了一位特殊患者——女明星藤崎瞳，她患的是胃溃疡。司马被心存妒忌的平贺偷偷推下楼梯，导致右臂扭伤。此时藤崎瞳并发胆囊炎需要手术，但由于其特殊身份不能开刀，司马提出“腹腔镜胆囊摘除”的高难度手术建议，却因受伤无法自己完成。中川应允亲自主刀，却在手术开始后右手颤抖不已，遂佯做晕倒，退出手术。司马带伤进入手术室，欲指导峰医生操刀，此时石川赶到替下了峰，并仅依靠司马的几句简单提示就完成了这个高难度的手术。

山村医生在检视体检的X光片时，发现石川的片子竟有胃部阴影，他找来大榇商量，大榇将此事告诉了司马，并要求司马千万不可告诉石川。医生们决定集体对石川隐瞒真相，石川自己却对“胃溃疡”的检查结果愈来愈感到怀疑。癌症晚期患者世岗在病房内吹黑管，曲不成音，令护士们和病友无法忍受，到稻村那里投诉，稻村却认为世岗的行为是一个不久人世的人对自己生命的寄托，极力劝大家忍耐。司马找星野谈购买医疗器材的事情，并公然要求回扣。前野医生终于对世岗的吹奏忍无可忍，大声制止他，并说出是司马主任的命令。世岗极度难过，一个人跑到楼顶在黑暗中哭泣。石川知道此事后愤然去找司马理论，却被司马说“与其调查别人的事，不如好好关心一下自己。”

　司马直接告诉石川，他患的是胃癌，而且已经相当严重。石川震惊之余，经过认真考虑，向中川部长请求让他工作到坚持不住为止。天真楼医院接下一个需要四组医生接力进行的大型手术“体外肝脏移植”，这次手术事关医院的声誉。中川部长让司马主持手术，司马决心要在时间上打破此类手术的记录。星野来找司马推销自己公司的器材，并答允给司马35%的回扣。司马在翻看产品目录的时候意外发现有销售NRD（一种低副作用治疗癌症的放射仪器）那家德国公司的名字，但星野的公司目前并没有NRD的代理权，司马遂以引进NRD为条件答允星野购买她们公司的全部产品。大榇无意中发现了中川右手颤抖的秘密，由此猜测出了中川和司马之间曾经发生过的事情。司马主持的手术以9小时50分钟的时间成功打破了日本的记录，并在第二天就有大幅照片刊登在报纸的头版头条，天真楼医院风光无限。

　楼顶的平台上，司马找到世岗，为前一阵阻止他吹黑管的事情道歉。世岗表示并没有记恨司马。同时他对司马说感觉到自己将不久于人世，希望在临死的时候不要受太大痛苦，也不想再拖累家人。司马向他提出了“尊严死”的建议。司马用星野给他的钱同时向中川和平贺行贿，并威胁中川若不服从自己便将他不能动手术的事情说出去，中川有苦难言。石川对司马全部医疗器材都从欧特购买感到奇怪，怀疑司马收了欧特的回扣，要求中川部长检举司马的不法行为，并找到星野以长期购买欧特的产品为交换条件请她为行贿一事作证。购买会议上，中川说出了司马收授贿赂的事情，并拿出了司马交给他的钱。但在会议休息期间，司马用重金贿赂医院理事长。其后，在与星野的对质中，双方心领神会地将事情引到了替司马收钱的平贺身上，中川顺水推舟，司马顺利过关，平贺则当作替罪羊被医院开除。稻村劝石川好好珍惜自己和喜欢他的峰，不要再浪费时间与司马作对。

石川的手术定在了三天之后，中川决定由前野医生为石川主刀。世岗的病情恶化，但在发病之前却没有来得及向院方做出“尊严死”的书面申请。司马看着全身插满管子的世岗，深深地感受到他生不如死的痛苦。石川认为，只要病人家属有意愿，医生就应该全力延长患者的生命。司马却说，救活他，和不让他死，并不是一回事。病房里，在世岗眼神的恳求下，司马遣开护士，为世岗注射了petararufan，世岗在满足的微笑中离开了人世。护士千代将司马在病房留下petararufan针剂的事情告诉了石川，石川将此事当作了自己将司马扳倒的最后机会。不仅将实情告诉了世岗的家属，还联系了新闻媒体。院方对此事大为头痛，中川部长和理事长也认为无法再包庇司马的行为，司马被迫辞职。石川终于达成了最后一个目标，紧接着就吐血晕倒在办公室里……

医院门口，大榇叫住了正准备离开的司马，请求他救救石川。司马向中川要求由他主刀为石川手术，中川同意了此事，石川本人却拒绝在手术协议上签字。经过峰的极力劝解，石川终于同意由司马为自己开刀。司马对石川说，他目前情况的获救可能基本是零，但要求石川自己以求生欲望将生存可能提升为10%，而他将以医生的身份努力将之提升为20%。手术室里，司马和峰携手奋战，经过数小时的努力，手术顺利完成。司马的脸上终于露出释然的微笑。石川苏醒后，两个人的手紧紧握在了一起。司马收拾东西准备离开医院，而就在这个时候，石川突然发生肺阻塞，司马赶到病房全力施救，却终于无力回天。冬日的街道上，离开医院的司马漫无目的地走着，此时，被医院开除的平贺悄悄地靠到了他的身后。

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