在逃离福克斯河监狱八小时后，克尔，林肯，苏克雷，阿布鲁齐和C-Note都在逃命而贝里克则带领狱警追捕逃犯。萨拉医生因服药过量而生命垂危;维罗妮卡被特伦斯囚禁。 T-Bag试图在逃离当局的过程中占据上风。事实证明，联邦调查局的一名新负责人是斯科菲儿德的得力搭档。

迈克尔和林肯计划再次越狱。

因为马宏的追捕，迈可尔和林肯的车着火被烧毁了。苏克雷踏上了阻止马里克鲁兹冒险的道路;C-Note决定与他的妻子和女儿团聚，尽管他们被监视着;一张熟悉的面孔紧盯着萨拉，她发现桌子都倒向了她;贝里克决定利用越狱的机会，与一个不太可能的盟友合作。

贝里克与迈克尔，林肯和尼卡联手合作，希望能发现隐藏的500万美元。一个家庭顺道载了陷于困境的T-Bag，他们才了解到搭便车的危险;阿布鲁齐重新回归家庭，决心报复菲波诺奇;凯勒曼对萨拉采取行动，接到她一直在等的电话，;马宏终于得到了他想要的人。

马宏突然对库珀的“神话”产生了兴趣，他在联邦调查局总部收到了一份特别的快递。迈克尔和林肯决心率先找到威斯特摩兰的双K牧场在犹他州的位置； T-Bag希望他的记忆不会让他失望； C-Note的火车行驶颠簸； 苏克雷去拉斯维加斯竞选，以阻止马里克鲁兹的婚礼； 凯勒曼进了（萨拉的）门。

迈克尔和林肯在犹他州寻房，寻找威斯特摩兰藏着的钱。T-Bag展示了他独特的南方待客之道；海维尔终于重新露面；苏克雷在路上发现了熟悉的面孔；马宏对库珀传奇的兴趣让他更接近这些逃犯。

林肯决定与LJ团聚，LJ对他在亚利桑那州的好运气持怀疑态度。迈克尔，C-Note，苏克雷和T-Bag对埋藏宝藏的寻觅终于得到了回报； 因为萨拉被公司定为目标，凯勒曼改变了主意。 马宏强迫吐温纳做出致命的选择。

当苏克雷叛变并带着新发现的500万美元逃跑时，迈克尔忙得不可开交。马宏因吐温纳的死亡被内务部调查;林肯决心与LJ重聚，但可能会走进公司的陷阱;当阴谋试图使历史重演时，萨拉必须为自己而战。

迈克尔对马宏的妻子采取了行动，希望能挖出追捕他的人的丑事。林肯和LJ的公路旅行很不舒服;C-Note的妻子必须在丈夫和女儿之间做出选择;T-Bag寻找旧爱的时候，收到了一个不受欢迎的惊喜。

迈克尔和萨拉团聚，马宏和凯勒曼决心将他们永远分开。当LJ遇见一位失散多年的亲戚时，林肯从父亲那里得到了一些帮助。苏克雷计划与马里克鲁兹一起逃跑。 T-Bag抓住了他自由的关键，却遇到了熟悉的面孔。

林肯在尝试与迈克尔团聚时必须与另一个亲人道别。迈克尔试图确保一架逃跑的飞机被迫停飞了;马宏破译了一个关键的拼图;T-Bag报复了折磨他的人;萨拉和凯勒曼紧张对峙，他们只有一个人能挣得最后一口气。

一次家庭团聚勾起了迈克尔童年的痛苦回忆。马宏追踪受伤的土狼，将他带到逃跑、逃生飞机上。 C-Note尝到了一些不好的药；贝里克和凯勒曼从生活中的女人那获得了第三学位。

T-Bag发疯似地去找失踪的霍兰德太太。苏克雷的逃生飞机遭遇致命的气流。贝利克一回到福克斯河监狱就被判有罪。迈可和林肯被收押回福克斯河监狱，这迫使马宏和凯勒曼采取了极端措施，以确保兄弟俩能到达监狱的停尸间，而不是他们的牢房。一个出人意料的盟友改变了所有人的游戏。

迈克尔、林肯和凯勒曼在试图抓捕特伦斯·斯蒂德曼的过程中遇到了一点障碍。马宏家里遭遇了悲剧;当一个狱友对他好的时候，贝里克变得不适应;C-Note作为一个单亲母亲面临着逃亡的生活;T-Bag迫使霍兰德家族和他一起过家家。

迈克尔，林肯和凯勒曼操纵了电波，他们试图躲过监管向失踪的萨拉传达信息。贝里克在福克斯河的疗养院里，一个出人意料的人来拜访他了；海维尔重出江湖遇到了更多麻烦；苏克雷开着他的豪车。

迈克尔和萨拉在去跟总统对质的火车上不只是陌生人;马宏招募了一个新盟友帮他捕获逃犯;当欢迎的马车到来时，T-Bag摆出了笑脸;第四个逃犯遇到麻烦了。

迈克尔和萨拉意识到沃登·蒲伯是恢复信息的关键，该信息会让“ 公司”崩溃。 马宏拐弯了另一个逃犯；C-Note担心女儿的一生； 苏克雷了解到与马里克鲁兹团聚时搭便车的危险； 当T-Bag带霍兰德一家回到他的童年时代的家时，回忆了种种往事。

林肯，迈克尔和萨拉找到了揭露阴谋所需的证据。马宏强迫逃脱者将迈克尔和林肯吸引到外面。 T-Bag拜访精神科医生的办公室不仅仅是为了看病。贝里克被派往边境以南。凯勒曼把目光投向了总统。

在凯勒曼准备暗杀时，迈克尔决心与总统面对面，并通过录音带揭露她的秘密。马宏和萨拉玩了一场紧张的等待游戏。T-Bag丢失的行李可能是贝里克和苏克雷的意外之财。C-Note的过激行为让他陷入了困境。

为了让迈可和林肯自由，萨拉不惜牺牲自己。T-Bag的恐怖统治继续南部边境蔓延，贝里克强迫苏克雷交出不见的钱;马宏终于开始行动了;逃亡者终于尝到了自由的滋味。

就像贝里克下定决心要拿到钱一样，迈克尔下定决心要抓到T-Bag。林肯和马宏走散； 当凯勒曼决定自己的命运时，萨拉也将面临审判日。

迈克尔争分夺秒地营救林肯，并在马宏自己的终极游戏中击败了他;苏克雷冒着生命危险去救失踪的马里克鲁兹; 凯勒曼在萨拉的审判中的证词证明是致命的;T-Bag和贝里克发现自己在巴拿马河上游。

迈克尔·斯科菲儿德被关进了索纳监狱，这是一座地狱般的、致命的巴拿马监狱。这个地方之前发生暴乱迫使当局下台，囚犯们自己决定自己的生活(和死亡)。随着他所爱的人的命运悬而未决，迈克尔必须找到隐藏在监狱下水道系统中的神秘狱友惠斯勒，以便将他从没有出路的监狱中解救出来。同时，林肯在寻找失踪的萨拉时收到关于LJ的令人不安的消息。

迈可赶在马宏之前找到了躲藏的惠斯勒家人。在监狱外寻找线索时，林肯遇到了一位老朋友，并结识了一位新朋友:当囚犯们因为缺水而威胁要造反时，T-Bag躲避了勒齐的视线。

迈克尔决定和萨拉谈谈，他让T-Bag帮他找到了索纳中唯一的电话：勒齐的电话。林肯试图大胆营救。 惠斯勒对迈克尔坦白，同时马宏很想摆脱肮脏的习惯。 贝里克想重新开始时结了仇家。

在营救LJ和萨拉失败后，林肯收到了来自“公司”的致命警告。迈克尔制定了一个激动人心的从索纳逃跑的计划;马宏被过去的一张脸所困扰。贝里克和勒齐一起倒在热水中时，T-Bag爬上了梯子。

一名新犯人进入索纳监狱，让惠斯勒感到不安，也引起了迈克尔的怀疑。林肯计划与索菲亚的海洋越狱，因为苏珊提前了越狱时间;T-Bag靠自己的魅力交到了新朋友；苏克雷试图将货物运进索纳。

当一名囚犯被发现被谋杀时，惠斯勒成为了头号嫌疑人，迈克尔必须证明他的清白才能救他的命。迈克尔要求苏珊提供萨拉还活着的证据，否则他将取消越狱计划;林肯和索菲亚监督警卫们的早晨仪式;在这集特别的两部分里，马宏得到了一个可以让他离开索纳监狱的机会。

随着迈克尔和惠斯勒被迫战斗至死，他们之间的忠诚也在不断发生变化。勒齐的力量受到了损害;林肯和索菲亚试图拯救他们所爱的人;苏珊的神秘雇主被揭露。

苏珊决定自己逃生，这使迈克尔陷入了困境。勒齐揭示了埋在索纳下的秘密； 索非亚发现了更多关于惠斯勒的过去。 马宏的自由取决于他的证词。 林肯和苏克雷成为公司的目标。

在引起巴拿马军方的怀疑后，迈克尔以索纳式的方式独自卖力地工作，而贝里克在挣扎求生。当T-Bag计划逃跑时，苏珊把目光投向了苏克雷。

勒齐失去了在索纳监狱的威信，萨米让迈克尔的逃跑计划泡汤。T-Bag向贝里克施压，要求他再拼一次，这可能是他的最后一场战斗。林肯和苏克雷为苏珊准备了一出大爆炸式的结局。

大雨迫使迈克尔提前了越狱计划，并在当晚逃出了索纳监狱。又一名囚犯加入了逃跑，西奥多和勒齐组成了联盟，而贝里克希望与马宏结盟。林肯和苏克雷给索纳监狱带来了希望。

迈克尔和他的狱友从索纳逃脱，但越狱并未像所有人的计划那样进行。

为了救LJ和索非亚的命，迈克尔和林肯必须将惠斯勒交给苏珊。马宏抓住了千载难逢的机会； T-Bag在索纳展示了谁才是老大；熟悉的面孔回到索纳，而另一人则被装进尸体袋而离开。

迈克尔在洛杉矶发现了令人难以置信的消息，他想为萨拉的死报复惠斯勒和格雷琴。马宏遭受了毁灭性的损失。迈克尔和林肯与同伴们重聚，并接到了一个他们无法拒绝的国土安全局特工的邀请。

一伙人开始了他们的国土安全局特工的任务。T-Bag在逃往自由的途中被落下了。

迈克尔和他的团队有一天的时间找到下一个持卡人否则他们就有可能回监狱。怀亚特试图获取萨拉下落的信息，马宏寻求报复，而T-Bag找到了通往他的新身份和未来的大门。

迈克尔找到了第二张卡片。T-bag伪装进企图破解线索。

迈克尔追踪下一张卡钥匙到了财政部；苏克雷和贝里克搜寻T-Bag。他在新工作中引起怀疑，并在新工作中结成了不容易的同盟。怀亚特与格雷琴交往。

迈可尔追踪一个持有钥匙卡的人到赛马场，而马宏发现了一些值钱的东西。格雷琴家庭团聚；怀亚特盯上了赛尔夫探员的雷达。T-Bag开始破译惠斯勒的密码。

林肯将成员都带到了拉斯维加斯，苏克雷在那里提出了不合适的提议。 萨拉了解到迈克尔的病情，而罗兰则放弃了自己的好运。 格雷琴与T-Bag合作，后者向迈克尔提出了他无法拒绝的提议。 同时，惠斯勒的鸟书的秘密终于要揭晓了。

林肯和苏克雷的目标是“将军”，以获得第六张也是最后一张牌的钥匙，格雷琴给了萨拉一个机会来解决这个问题。迈克尔和罗兰各自与不同的恶魔做交易，而一个团队成员发现自己站错了边。

怀亚特尝到了自食其果的滋味，马宏找到了解决办法。当警察调查他失踪的同事，T-Bag慌乱起来。而格雷琴与一名公司员工相处融洽。迈克尔的病情持续恶化，一名队员在计划地下入侵“锡拉”时做出了最大的牺牲。

迈克尔被迫去医院，把苏克雷和林肯留在了随时可能引爆的情况下；马宏指定了公司的设计师 ;赛尔夫探员遇到了一个出人意料的盟友。

迈克尔和时间争分夺秒，带着虚弱的身体闯入“公司”总部，偷走“锡拉”，但成功的关键在于苏克雷。格雷琴盛装打扮，准备与将军会面，并进行最后一次尝试，试图拿到最后一张卡的钥匙。T-Bag必须做出决定，他将永久放弃犯罪的想法。

在寻找“锡拉”的过程中，萨拉挟持了人质，T-Bag和格雷琴在大门口做了最后的抵抗，迈克尔和林肯与将军面对面，却被自己的同伴出卖了。

在他们被自己人出卖之后，迈克尔必须将他们团结在一起。 T-Bag找到了一个新搭档，他勒索格雷琴为锡拉寻找买家。

迈可和林肯争分夺利地从格雷琴和她的新搭档那里夺回“锡拉”。格雷琴和她的新搭档也同样决心从兄弟俩那里找到丢失的那块拼图。与此同时，马宏遇到了一个老同事，让他在友情和责任之间两难，T-Bag的信念在劫持格雷琴的家人时受到了考验。

迈克尔在最不可能的地方得到了医疗照顾，查尔斯·威斯特摩兰回来帮助揭开“锡拉”的真正含义。与此同时，在“锡拉”永远消失之前，林肯和苏克雷试图阻止格雷琴。

林肯和他的新搭档来到迈阿密，从令人震惊的新主人那里找回“锡拉”，萨拉在寻找失踪的迈可尔，迈克尔得知了一些关于他过去的惊人信息。与此同时，一场欺骗导致了死亡和逮捕。

迈可和萨拉在去迈阿密的路上知道了搭便车的危险，林肯遇到了克里斯蒂娜，克里斯蒂娜告诉他她要接管“公司”的计划。与此同时，“将军”受到了新敌人的猛烈攻击，T-Bag和赛尔夫寻找“锡拉”的过程中出现了一个意想不到的发现。

迈可和林肯为“锡拉”展开了正面交锋，克里斯蒂娜下令一枪致命，并开始实施她的计划。萨拉收到了意想不到的消息，T-Bag在印度大使馆大闹，而“将军”的偏执导致其死亡。

迈克尔与克里斯蒂娜的重逢令人不安，因为他告诉林肯一个爆炸性消息，林肯跑去阻止克里斯蒂娜的致命计划。T-Bag必须证明他是公司的人。

暗杀发生后，酒店里爆发出一片混乱，克里斯蒂娜制定了她计划的最后部分。与此同时，将军兑现了他的承诺，迈克尔被迫在拯救林肯和萨拉之间做出选择。

迈克尔将会最后一次把“锡拉”交到合适的人手中，彻底摧毁“公司”。

迈克尔和林肯安排了交易的地点，并已知道如果交出了锡拉，所有知情人都无法活下来。