דני, ווהן, ג'ק ודיקסון מקבלים בוס חדש. ווהן וסידני תוהים האם הם יצליחו להתפייס. סידני לומדת סוד נורא על אביה. נדיה לא מתלהבת לחזור לעולם הריגול.

דני, ווהן, ג'ק ודיקסון מקבלים בוס חדש. ווהן וסידני תוהים האם הם יצליחו להתפייס. סידני לומדת סוד נורא על אביה. נדיה לא מתלהבת לחזור לעולם הריגול.

סידני מנסה לשכנע רוצח להתאהב בה כדי לאתר מפצח-קודים גנוב. ווהן מפחד שוייס נהרג. סידני וג'ק מתווכחים האם לספר לנדיה את האמת על אירנה.

סידני חושדת בדאגה האבהית של סלואן כלפי נדיה, והיא ונדיה יוצאות למשימה חשאית כיורשות עשירות במטרה למצוא את מיקומו של כימיקל קטלני.

סידני ווהן יוצאים למשימה חשאית כדי לאתר נשק ביולוגי קטלני, שדיו הפניימים של ווהן לגבי אשתו המתה לורן מתחילים לעלות אל פני השטח ונדיה חוקרת את ג'ק לגבי אמה, אירינה.

סידני מודבקת בסם הזיה קטלני, מה ששולח את ווהן וג'ק למרדף בעקבות הנסיוב לפני שתוצאות התנהגותה האלימה יכלו אותה.

כדי להציל את נדיה, סידני חייבת להפיל את אויבתה לשעבר, אנה אספינוזה, בזמן שווהן מתעמת עם מר סארק.

סארק מבקש מווהן לאשר לו בקשה זדונית לפני שהוא יעזור לו ולסידני לאתר את אנה אספינוזה. ג'ק מתלבט האם לסכן את חייה של נדיה כדי לחלץ מידע לגבי מקום המצאה של אנה.

סידני ו-ווהן יוצאים למשימה חשאית כזוג נשוי מהפרברים במטרה להחרים נשק קטלני שעלול לגרור את החברה חזרה לימי הביניים.

יחסיה של סידני עם נדיה מאוימים מכיוון שהיא מאמינה שסלואן מנסה לבנות מחדש את "הברית". ווהן מגלה סוד מבהיל הנוגע לאביו.

סידני מעמידה את חייו של אזרח אמריקאי בסכנה. ג'ק מתכנן ביקור קטלני אצל חבר ותיק. ווהן חושף עוד סודות מטרידים לגבי אביו.

עברה המשותף של נדיה עם אדם הנמצא תחת חקירה מעמיד את חייה ואת חייו של הצוות בסכנה. ווהן מגלה דבר מה הנוגע לאביו ולנדיה.

סידני ווהן עלולים להפסיד הכל בחיפוש אחר האמת על אביו של ווהן. ג'ק וסלואן זוממים יחדיו נגד סידני ווהן. ג'ק מתמודד עם בחירה קטלנית שתשנה לתמיד את חייו וחייה של סידני.

סידני מקבל חדשות מזעזעות מקטיה דרבקו לגבי מותה של אמה. ווהן גונב מתקן כדי ללמוד את האמת על אביו. מרשל מפקפק בבריאותו של ג'ק.

סידני נאלצת לצדד בסלואן כדי לתפוס את האדם שהתחזה לו. נדיה מודאגת מכך שאביה יגלה מחדש אובססיה מעברו.

לאחר שמשימה של סידני משתבשת, מרשל הוא האדם היחיד שיכול להצילה. דיקסון נחשף לווירוס ביולוגי קטלני.

סידני ונדיה מגלות שסופיה הוכתה קשות. סלואן חושש שחייה של נדיה נמצאים בסכנה לאחר שהוא מגלה את הסיבה להכאה.

סידני מזועזעת מכך שג'ק בחר לא לספר לה שהוא חולה סופני. המטפלת של נדיה מבית היתומים ממשיכה להחלים בדירתה של סידני.

הקבוצה לוכדת את המתחזה של סלואן וחוקרת אותו כדי למצוא סחלב נדיר של רמבלדי. סלואן האמיתי חייב לחוות שוב זיכרון כואב מעברו כדי לגרום למתחזה לגלות את מיקומו של הסחלב.

הייחוס ב-איי-פי-או מגלים את האמת הקשה אודות סופיה, חייו של סוכן נמצאים בסכנה, סידני ונדיה מודאגות שהאובססיה של סלואן לרמבלדי מתחדשת ולג'ק יש פגישה מטרידה עם קטיה דרבקו.

לאחר שהם מגלים שאירינה דרבקו בחיים, סידני, ג'ק ונדיה חייבים למצוא אותה כדי לסכל את השימוש שעושה אלנה דרבקו במהלך הסופי של רמבלדי.

בפרק האחרון לעונה, אלנה דרבקו מתחילה את המהלך הסופי של רמבלדי ועל סידני, ג'ק, אירינה, ווהן ונדיה להציל את העולם מהשפעתו ההרסנית.