希干希纳区的人们为了保护自己不受巨人吞食，特地建造了四周高达五十公尺的城墙，百年来因此过得很平安，但艾伦满心向往外面的世界，对宁可像家畜般在墙内苟且偷生的人们感到不以为然，没想到巨人们这一天真的摧毁了城墙，还当着艾伦的面吞噬了母亲……。

由于巨人的入侵，希干希纳地区的居民生活遭逢巨变，夹杂在悲鸣与怒吼声下，人们不断逃窜，却也无能为力，最后幸存的人搭船逃到罗塞之墙内。亲眼见到母亲被吞噬的艾伦，在汉尼斯的拯救下逃离後，内心燃起熊熊大火，誓言要打倒巨人……。

为学会杀巨人最有效的手段“立体机动术”而加入训练兵团的艾伦、三笠、阿尔敏，在基斯教官的严格训练下，与来自不同出身地和不同观念的同僚们，逐渐建立起同袍感情，但艾伦却不如三笠等人，在控制姿势训练中失败了……。

加入训练兵团三年，在基斯教官的严格训练下，艾伦和三笠、阿尔敏终於要毕业了，但艾伦却发现学会“立体机动术”等杀巨人的技术，竟同时也是让自己远离巨人到安全圈去的技术，因为成绩高的人，将被派到内地的宪兵团里，在国王底下负责维持秩序……。

希干希纳区的惨剧发生后五年，艾伦又遭遇到当年毁掉玛利亚之墙的巨人，于是立刻发动立体机动装置，想攻击巨人的要害，但巨人却在一阵蒸气中消失无踪。由于城门已被攻破，为预防巨人们的第二波进军，艾伦们准备展开防卫殊死战……。

34班的同伴们纷纷倒在眼前，就连艾伦也为了救阿尔敏而被巨人吞下，残酷的事实让阿尔敏无法接受。　　另一方面的三笠，为了救正在逃难中的居民，冷静地压制了商会会长，同时也回想起与艾伦相识的悲惨情景来……。

阿尔敏等人因为立体机动装置快用完燃料无法登墙，正好三笠赶来了，提议大家赶往补给部队所在的本部补充燃料，还率先采取行动，却因为得知艾伦丧生的消息内心动摇并失去冷静，在面对巨人时，更丧失了求生意志……。