Alexis qui est à la recherche de ce qu'elle veut faire dans la vie, décide de suivre des stages. Comme elle n'a rien dit à son père, celui-ci découvre par hasard qu'elle fait un stage avec le Dr Lanie Parish. Richard n'apprécie pas trop de la voir évoluer dans ce domaine.

Entre temps, l'équipe de Beckett enquête sur la mort d'un homme inconnu. Étrangement, selon Lannie, l'homme a été étranglé, poignardé, s'est fait tirer dessus, a un crayon planté dans le cou pour être ensuite jeté d'une fenêtre. Bien vite l'équipe de Beckett base leur soupçon sur Thomas Gage. Ce dernier n'avoue rien, mais informe Kate et Richard qu'il n'existe pas, pire encore, qu'il va disparaître. Comme de fait, Thomas Gage disparaît, mais aussi la victime de la morgue. Alexis s'en veut de s'être fait voler le corps sous ces yeux, mais Lannie la rassure.

Au cours de l'enquête, Kate et Richard découvrent que Thomas Gage est relié à un certain projet Pandora. Au moment où l'inventeur du projet Pandora commence à révéler ce que c'est, les malheurs commencent pour Kate et Richard.