民国初年，北京天桥的席棚书场里，江湖艺人“铁嘴霸王”在讲述着身怀绝技、除暴安良、杀富济贫的江湖大侠——燕子李三不幸被捕的故事。一个瘦小的孩子站在一条长凳上，听得格外认真。燕子李三将要被处决的消息在京城不胫而走，群众纷纷走向街头，为自己的英雄送行。法场路上，万一神秘的黑衣人拨开人群紧紧跟着囚车，人群中爆发出一阵呼喊：“好汉，唱一段，来个交待”。跪在囚笼里的李三面对热爱自己的群众含笑点头，突然他发现黑衣人伸手摸出飞镖，李三摇了摇头，声嘶力竭地唱道：贤弟呀，你不要莽撞，来日方长啊......姬麒麟饰演李显黑衣人缓缓放下手来，突然后边人群涌动，一个小孩高举着馍头挤出人群，向囚车追来。执刑官玉大兽一记鞭子抽来，小孩倒地，玉大兽收起鞭子骂了声“小杂种”扬长而去。玉大兽原是李三的好友，为得到官府的赏赐出卖了李三，这才使一代豪侠命丧黄泉。庆功宴上玉大兽阴沉着脸，来宾不解其意，玉大兽说：“李三虽已除掉，但他有一个师弟姓李名显，穿墙越户的本领不在李三之下，此人一日不除，我们便一日不得安宁。”众人面面相觑。突然楼道里一阵响动，众人惊讶地看去，又是书场里的小孩呆呆地站着，玉大兽喝道：”谁让你来的，小杂种，滚出去“。深夜，乱坟岗，小孩悄悄地走来，爬上一棵树，偷偷地向下看去，新坟前黑衣人将李三的牌位插好，倒头便拜。忽见四周的坟头蠕动，小孩大叫一声摔下树来，李显警惕地抬起头来，刹时坟头爆裂，窜出十几个人来将李显团团围住，土坟后走出玉大兽，他冷冷地说：“李显，今天请来江湖高手，这儿就是你的葬身之地。”十几个高手闻声而动，李显施展轻功，左冲右空，身受重伤，杀出重围，被日本郎中五咸救出，为报五咸救命之恩，李显留下3个小燕子风筝，相约以后有事，定当万死不辞。李显收了小孩，为之起名李云龙。从此，他与云飞、云馨成了“燕子门的正式传人。东北普照寺的堂畿和尚是李显的至交，李显带着3个弟子来到这里，决心十年铸剑，报仇雪恨。在师父、师兄、师姐的调教下云龙的武功后来居上，深得李显喜爱。

一天普照寺来了位不速之客，偷看燕子门练功，被李显发现，来人为五咸所派。原来日本人早就图谋东北，屡次派人窃取张作霖的情报而不得手，于是五咸以燕子风筝为凭来找李显，李显为报恩设计偷了情报，却引起张作霖对燕子门的注意。转眼之间，燕子三杰已长在成人，李显命云飞、云龙下山诛杀玉大兽，云馨争着要去，李显以她是女子为由坚决不允。云馨剪掉辫子女扮男装私自下山。云飞、云龙昼伏夜行来到北京，明查暗访，弄清了玉大兽的行踪，得到了进入玉大兽密室的线索。云飞、云龙突破暗道机关找到玉大兽，这时云飞才知道云龙是玉的儿子。仇人想见，分外眼红，云龙杀了玉大兽后，又触犯门规杀了玉的小妾和仆人。燕子李三的关门弟子九天鹤突然来到普照寺，请李显出山为张作霖效力，遭到李显拒绝，张作霖大为恼火，欲巢灭燕子门。燕子李三-李云龙云龙将玉大兽的人头挂在了十字街头的旗杆上，北京城内百姓争说“燕子李三”重现江湖。

云馨来到北京天桥以轻功绝技教训了强收民众占地费的“独眼彪”，遇到师兄、师弟，得知燕子门大仇已报，怪怨他们不带自己，故意不理云飞。归山后的云飞将滥杀无辜的罪名揽到自己身上，正在接受李显的盘问，云龙则在云馨的屋里给她展示偷工减料来的外国香水、高跟鞋、八音盒等千奇百怪的东西。云龙、云飞回山已有两天，李显对他们均无褒奖，堂畿知道这是李显暗中观察徒弟的品行修为。云飞不居功，不自傲，反复向师付讲云龙为燕子门立了大功，而将违反门规的责任承担起来。云龙却飘飘然起来，自以为武功好便可以横行天下。李显看在眼里。九天鹤听说云飞、云龙回山已有两天，再次来到山庄崔李显派弟子到张作霖军中效力，否则将采取武力解决。李显为避祸，以惩罚云馨私自下山为由，接着又设苦肉计，让云龙先离开东北，躲过了奉军的纠缠。

燕子李三-李云馨奉军占领北京，“铁嘴霸王”不能再说《燕子李三》，只好返回老家山东，染病在身。为给“铁嘴”治病，李云龙先偷了韩复榘的金表，又在谭家麟与女戏子绿牡丹调情之际，偷了他的皮包，发现了韩复榘与日本人签署的秘密文件，“铁嘴”气愤地把这些东西送到报馆，报馆不敢登载，又将文件转给了韩复榘，谭家麟因此被降为警察局长。云龙走后，李显了结了与奉军的纠缠，派李云飞下山为燕子门南下打前站，云飞、云馨从小青梅竹马，二人即将分手，依依不舍。

李显的师弟李德，心地善良，疾恶如仇，从小苦练轻功，但始终没有什么长进，为躲避官府追捕，10年来隐姓埋名，开了一家店。济南第一刀“金钱豹”自恃武功高强，勾结官府，强行将老百姓祈天坛据为己有。李云龙偷文件的事被“铁嘴霸王”编成新《燕子李三》到处传讲，引起日本郎中五咸的注意，于是挑动”金钱豹“寻找燕子门比武。李德从食客口中得知燕子门重现江湖，于夸耀自己才是燕子门传人，受到奚落，正在闷闷不乐，云飞突然出现，李德惊喜万分。李云飞、李德接受了“金钱豹”的挑战，在祈天坛与“金钱豹”比武，李德首先上场，却险些命丧敌手，这时云飞才知道这位师叔原来不会轻功，击败“金钱豹”，将祈天坛还给老百姓，于是人人都说“燕子李三”出现了。受了重伤的“金钱豹”被五咸治好，从此成了五咸的走卒。

　李显、云馨来到济南，见到李德得知云飞、云龙这阵子都受到磨练，十分高兴，燕子门以“大名当”为掩护，重操趟镖旧业。云龙始终暗恋着师姐云馨，而云馨却把他当做自己的弟弟，深深爱着师兄云飞，没有觉察到云龙对自己的感情。在书场听了“铁嘴霸王”编讲的燕子李三祈天坛大战，她更是敬慕师兄的武功和人品。一天，几个大汉拿着两只干枯的耳朵找燕子门报仇，李显定下时间，做生死了断，原来这耳朵是当年老燕子李三教训黑道人物刘三炮而割下的。李显心知这场恶战凶多吉少，于是告诉李德要设法挡住3个徒弟，自己独身赴约

李德受不了云飞的恭维，说漏了嘴，只好 将老李三与刘三炮结仇之事告诉了云飞、云龙。第二天，城外乱坟岗，一场生死决战就要开始，李德、云龙、云飞、云馨从两个方向跑来助战。李显喝退他们，独身与5个大汉较量。5个大汉先被打入他们自己挖好的坟坑中，李显转身欲走，大汉突然拨出枪来，云飞扑身上前挡住了师父，云馨又挡住了云飞，大汉开枪，却发现枪里已没有撞针，原来龙去脉昨晚李德、云龙已经做了手脚。庆功宴上，云龙看着云飞和云馨亲热的样子，心里别扭，借故到外边喝得酩酊大醉，云飞服侍他睡觉前，发现云龙怀中藏着云馨的辫子，明白了三弟原来痴恋着云馨。他想到他们3人从小长大的手足之情，想到三弟凄苦的身世，陷入矛盾之中。这以后，云飞有意冷淡云馨，希望三弟能遂心愿。“铁嘴霸王”评书塑造的燕子李三形象深受群众欢迎，进步青年白凝常来书场听书，做笔记，想把这个人物创作在自己的小说中。一天，云飞、云馨为找云龙来到书场，惩治了欺辱“铁嘴”的恶棍张宪帮，白凝目睹了云飞凌厉的身手，认定他就是自己心目中的英雄“神燕子”。李显知道女儿云馨深爱着云飞，而对云龙只是姐弟之情，可云飞却一味退让，他怕照此下去，不利云飞、云龙修炼，于是立下了新门规，规定他们3人只有手足之情，不能有情欲之爱。云飞、云龙不得已盟了誓，而云馨一气之下离开了香堂。

云馨履约陪着云龙在院中喝酒，此时李显也在酒馆与李德喝酒，商量如何解决3个弟子理不断的纠缠。云馨、云龙有了几分醉意，云龙亲切地唤着云馨的小名，云馨眼前却幻化出师哥的影子。她将脸靠在云龙的胸前，喃喃说着情话，恰在这时，李显从房上落下，斥责两个弟子违反门规。云馨酒醒，误认为云龙对自己轻薄，云龙飞身跃上房去，李显扬手一镖，打在云龙左肩。

李云龙带伤狂奔，跌倒在荒野中，被“铁嘴”的徒弟宋来救起，送到樱花诊所由五咸给他治伤。李显酒醒后，很后悔，忙吩咐云飞尽快找回云龙。五咸治好了云龙的镖伤，借机挑唆云龙离开燕子门，说只有这样才能横行天下，这正合了李云龙自以为自己天下第一的思想。一天，九天鹤送来一镖，李显派云飞、云馨前去，原来是偷爱国学生的文件，趟镖中他们认出了开会学生中有常来听书的白凝。学生们的爱国热情令李云飞十分敬佩，他要求将学生们的东西还给学生。云飞参加了地下党组织的光明文化补习社，想把白凝介绍给云馨，却引起了云馨的误解。李德好心安慰云馨，反弄巧成拙，让云馨更加怀疑云飞。

　李德心理一直牵挂着云龙，于是和云飞再去寻找。云飞去见秋红，知道了云龙最近常来，秋红的身世令云飞同情，人代表云龙表示一定要给秋红赎身。为秋红，李德瞒着李显帮云飞盗取了宝源钱庄，替秋红赎了身。不料宝源钱庄的后台是韩复榘，钱庄失窃，韩复榘大怒，利用江湖黑道人物散布说他要将国宝北魏佛头卖给日本人，云飞为保护国宝独身闯入宝源钱庄，中了圈套。

云飞被捕后，受尽了折磨，但他坚侦不屈，至死不说与光明补习社的关系，使韩复榘破获地下党的愿望破灭。李显筹划劫狱，白凝赶来劝阻，告诉他们谭家麟正张网以待，如去劫狱，燕子门将再中圈套。

　地下党负责人尚老师，决定通过营救李云飞掀起一场揭露韩复榘亲日卖国罪行的群众运动。白凝和同学们走上街头散发传单，集会请愿。为了笼盖亲日行为，韩答应释放李云飞，但由白父等人交纳10万元的保释金。云飞出狱后，对地下党有了更深的认识，认识到白凝所讲的靠几个江湖侠客是改变不了社会的道理是正确的。云龙深感此次师兄被捕，完全是为了他，内心十分惭愧，主动回到燕子门。

“铁嘴霸王”重新回到书场，听众中出现了一位神秘的女人桂芳，对《燕子李三》极感兴趣。金钱豹成了汉奸头子，他来到书场，给老百姓发放日本旗，遭到“铁嘴”拒绝，从此“铁嘴‘躲进破庙。桂芳为了解燕子门行踪，来到破庙听书。“铁嘴”给她说了一天，桂芳发现燕子李三所作所为好像是两个人或三个人，向“铁嘴”寻问，“铁嘴”说不清楚。日军高岛少佐自恃武功高强，不把中国武林豪杰放在眼里，不少江湖好汉死在他的刀下。金钱豹为报祈天坛之仇，施出一箭双雕之计，告诉高岛大名当中有几个身手不凡的好汉。

李显带着云龙接受了高岛的挑战，李显施展神功绝技，赤手震飞高岛战刀，高岛狼狈而逃。日军司令官腾田来到樱花诊所，拜访了特务头子五咸长满，五咸暗示要想征服中国必须“以华制华，攻心为上”。五咸利用手中还有两只燕子风筝，派人找李显趟镖。李显为实现江湖诺言，不问客房所求之事，带着云飞、前去趟镖，到达目的地，发现要化烧毁的一处院落竟是抗日救护医院。李显悔恨万分，告诉云飞、云馨到灵岩寺找堂畿合计。此时云龙恰巧回来，被从天而降的大网罩住院。藤田决定处决李云龙。消息传来，燕子门立即开始实施营救行动。

面对敌人准备的反扑，白凝及时向李显提出尽快关闭大名当、燕子门迅速搬到城外的建议，李显、云飞、云馨到灵岩寺找堂畿合计。此时，云龙恰巧回来，被从天而降的大网罩住。藤田决定处决李云龙，消息传来，燕子门立即开始实施营救行动。

五咸闻讯，为了笼络民心，阻止枪决李云龙，撤走日本军队，给李云龙制造了逃跑的机会。混乱中，李云龙施展缩骨功逃出囚车，跑入一死胡同，中弹倒地，被数名伪军围住。紧急中，桂芳手持双枪打死伪军救出云龙

　云龙渐渐爱上了桂芳，认为她不仅是自己的救命恩人，又和自己想法一致，桂芳趁机挑拨云龙与师父的关系，并鼓动他去杀几个有头有脸的日本人给师父瞧瞧。于是云龙暗杀了日本反战人士、金融家桥本，并留下燕子门的风筝标记。

　其实，桂芳是五咸培养的日本间谍，五咸深知李云龙的弱点，于是施用美色瓦解他的斗志。桂芳从云龙口中知道了只有他和师父知道的秘密相聚地点北极阁，于是冒李云龙之名写信扔到大名当，邀李显赴约。李显只身来以北极阁，突然金钱豹带日伪军将客楼团团围住，暗中开枪打伤李显。李显自知腿上所中的是毒弹，虽经堂畿排毒治疗，还是落下残疾，于是想将掌门人一职让给李德，李德却出主意将掌门人让给云龙，这样就能留住云龙。云龙闻讯十分高兴，桂芳却说这是师父想用掌门人套住他，使他从此听别人摆布。

其实，桂芳是五咸培养的日本间谍，五咸深知李云龙的弱点，于是施用美色瓦解他的斗志。桂芳从云龙口中知道了只有他和师父知道的秘密相聚地点北极阁，于是冒李云龙之名写信扔到大名当，邀李显赴约。李显只身来以北极阁，突然金钱豹带日伪军将客楼团团围住，暗中开枪打伤李显。李显自知腿上所中的是毒弹，虽经堂畿排毒治疗，还是落下残疾，于是想将掌门人一职让给李德，李德却出主意将掌门人让给云龙，这样就能留住云龙。云龙闻讯十分高兴，桂芳却说这是师父想用掌门人套住他，使他从此听别人摆布。

自从李云龙开始注射毒品，就越来越离不开桂芳了。五咸认为摊牌的时机已经成熟。一天五咸阴笑着出现在李云龙面前，李云龙没想到这个当年治好自己镖伤的老朋友竟是日本特务头子，更令李云龙感到意外的是，此时的桂芳身穿和服给自己送来毒品。李云龙意欲反抗，无奈毒瘾发作，于是束手擒。李云馨为救父亲，闯进日本宪兵队，中了五咸的埋伏

李显、云馨宁死不屈的消息传出后，舆论对侵略者十分不利，再加上日军在战场上连连失利，阴险的五咸为了长远的打算，决定放这两个江湖豪杰。李云龙在桂芳的指挥下为日这窃取情报，五咸十分满意，接着派他们潜入重庆窃取 情报再次得手。为了使情报不落入日本人之手，抗日团体派白凝、云飞、李德组成小分队，中途拦截。

金钱豹自投先靠了日本人，越来越有恃无恐，他听说秋红是百里挑一的美女，欲强娶秋红。锄奸队决定利用金钱豹娶亲之机锄掉这个大汉奸。洞房内，金钱豹正欲掀开盖头，潜入洞房的云飞突然凌空而降，二人又是一场惊心动魄的较量，最终云飞将这个穷凶极恶的汉奸击毙。这时大厅里，锄奸队拿出武器将前来贺喜的汉奸、特务一网打尽。

　日本即将失败，五咸给桂芳下令除掉李云龙以灭口。此时桂芳又爱上了李云龙，接到命令后尽管十分矛盾，还是布置了暗杀计划，但李云龙一次次都做了手脚，使暗杀失败。李显决定先给云飞、云馨定亲，等抗战胜利再举行婚礼。在定亲仪式上，李显嘱托云飞，如云龙还知悔改，就让他重回燕子门，如仍不悬崖勒马，就废去他的武功。深夜李德酒醉睡下李显不辞而别。

日本军旗下，五咸感触良多，他为他的“以华制华”活动的彻底失败而惋惜。这时，一枚飞镖破窗而入钉在军旗上，他知道是李显来了。搏斗中，五咸渐渐败下阵来，绝望中要求以武士道的方式自杀，这时李云龙、桂芳破窗而入，李显气愤至极，出手欲废云龙武功。而对师父的进攻，云龙反手一镖击中李显大腿。正在此时五咸一枪射来，李显中弹跃起，双手死死掐住五咸中喉咙，桂芳呼喊着必须杀人灭口，李云龙一掌向师父背后打来，李显口吐鲜血慢慢倒地。这一幕恰恰相反被赶来的李德看在眼里，李德奋不顾身冲上前来，云龙拉起桂芳逃之夭夭。

日本投降前夕，桂芳为五咸的“春之秋”行动能够继续实施做了最后的努力后回到寓所，在哀伤的日本音乐中，她为李云龙跳起了舞蹈，并告诉他：以后谁也不要相信。李云龙睡后，桂芳剖腹自杀。

大明书场里，听众以热烈的掌声欢迎“铁嘴”重新登台，共同庆贺抗战胜利。李云龙烦闷之极，借酒浇愁，又在回梦楼强逼被抢来的民女小翠兰，姑娘含恨上吊而亡。姑娘的父亲千里寻女，到处向人们诉说李云龙的恶行，又被云龙杀害。接收大中袁卓为平民愤，下令将李云龙定为汉奸，谁料警察局吴警长早与李云龙成了把兄弟，将消息传走，李云龙深夜拜访袁府，留下一盒金条，求袁网开一面。袁收了贿赂，在汉奸名单上划掉了李云龙，从此李云龙越发横行无忌。

云龙躲在秋红家中，九天鹤游说云龙投靠军统效力未果。云馨决定到深山中隐居修炼三年，想成全云飞和白凝两人。从此音讯全无。特务进戏院搜捕云飞，绿牡丹将云飞扮成薛平贵瞒天过海

人们到处传颂着云飞惩恶扬善的故事，秋红深有感触，于是劝云龙改邪归正。云龙说我是横行天下的神燕子，只要活着为所欲为，管别人说好说坏。李德一辈子没练出功来，自知要替师兄报仇，非得另辟别径，他苦研秘方配制散功茶，欲废去李云龙的武功。

李德来到回梦楼，见到李云龙，奉劝他痛改前非，李云龙反出言相讥。李德只好让杂役上茶，以茶代酒，做江湖了断。李德在回梦楼时得罪了杂役，所以杂役在沏茶时没按李德的要求，反将配制的散功茶放到李德喝的杯中，李德全然不知，喝下后突然出现奇迹。功力大增，轻轻一掌，就将李云龙打下床来。李云龙穿窗而过，跃上树梢，李德也跃上树梢。李德欣喜之余，却又不安，觉得自己配错了药，配的不是散功茶，而是增功散，自己每天只闻味，功夫尚且如此，李云龙喝了这茶功夫更是了得。他将这个担心告诉云飞，云飞决定会会云龙。师兄弟二人先是在塔林大战，李德也手相助，反将云飞撞倒，李云龙乘风筝逃走，李云龙紧追不舍，二人在空中又是一场风筝大战。李云龙毒瘾发作，身子渐渐沉重，风筝降到树梢，李云龙追来，李云龙借助树枝的弹力打断云飞风筝的翅膀乘机逃走

　李云龙经不住九天鹤的攻心术，成了九天鹤手下一名军官，他吃喝、嫖、赌、抽更加有恃无恐，感到眼着九天鹤这条路算是走对了。云馨深山修练已经3年，功夫大长，当小凤说到李云龙已投靠国民党后，李云馨决定下山报仇。在李显坟前，云馨痛心疾首，她深知李云龙已经有了靠山，报仇决非短期内能够实现，为不耽误师兄的前程，决心出家让师兄与白凝结成百年之好。云馨强迫一老尼给自己剃度，李德赶来，满头黑发已经落地，白凝赶来，见到的是云馨已将燕子门金镖传给了小凤。

　云飞在解放区接受了一年的培训后，回到省城，听说云馨已经出家，赶到大空寺，不解地追问云馨。云馨强压着内心的悲痛，劝云飞尽快和白凝成婚，云飞发誓道：只要你一天不还俗，我一天不成家。李德为师兄报仇之志不改，在山间小路拦住了潜逃在外的李云龙。二人来到李显灵堂，李德引发自制的暗机关，李云龙一一躲过，李云龙飞身开枪，李德中弹倒地。云飞赶来，李德含笑而去，云飞悲愤地高喊要为师父、师叔报仇。

解放大军以雷霆万钧之势攻下华东，省城回到人民的怀抱。人民群众发动起来了，任何犯罪分子都无处藏身，经买药人揭发，新任侦察科科长的云飞认定此人是九天鹤。公安战士组成小分队围剿玉和堂药铺，李云龙听到动静越窗而逃，九天鹤挡住了云飞的追路，李云飞勇斗九天鹤将其擒拿。逃跑后的李云龙更加穷凶极恶，因客店老板要揭发他，先杀伙计，后烧客栈，并开枪打伤前来指认的白凝。

李云飞与战友们共同制定了围捕李云龙的方案，全城人民已经发动起来，李云龙化装成乞丐、干部.......都无法躲开人们的眼睛。他自知已无处藏身，于是潜入大空寺，躲在大殿的房梁上。云馨得知白凝受伤的消息后，悄悄来到医院，默默为其祈祷。白凝昏迷中仍在念叨着云飞的名字，念叨着燕子门，云馨潸然泪下。云飞突然意识到李云龙一定躲在云馨出家的大空寺，因为要云龙极其狡猾，他一定会选取与他深仇大恨的云馨居住处来躲避才最安全。于是新追剿计划制定出来。大空寺前，李云飞去掉手枪，与李云龙相对而站，李云飞说：要用江湖方式擒他，交给人民处决。二人从殿前打到练功架，李云龙不敌逃走。云飞紧追不舍。

　街上灯火辉煌，无论哪里都有群众高喊抓飞贼，李云龙无处躲藏，逃到一废弃的练铁厂。为了减少伤亡，云飞让战士们包围车间，自己一人走进空荡荡的车间。李云龙开动天车，欲撞死云飞，云飞跃上天车，二人在行驶的天车上进行了一场生死搏斗。云飞以推碑手将云龙击倒，拦住欲杀他的云馨，将李云龙交给公安战士。天亮了，白凝听着首都天安门前的礼炮声兴奋地说道：天亮了，崭新的国家，崭新的人民，慢慢合上双眼。李云龙正法后，云飞将他埋在荒郊。他想起尚市长说过的话：我们不仅是埋葬了一个李云龙，而且埋葬了一个时代。云馨默默走来，二人相视无言。眺望着远方的霞光。书场里人头攒动，“铁嘴霸王”新编评书《神燕子》开说。他充满激情地说道：“有民政府威力大，得民心者得天下”。