經過這趟慘烈的海外任務，海豹突擊隊少校詹姆斯里斯返回國土，他記憶錯亂，還要受到上頭的問責。

里斯鎖定了第一個目標，並獲得班的協助。他精神狀況成疑，凱蒂和里斯彼此看不順眼，卻同意要合作找出答案。

里斯捲入了更龐大的陰謀，名單上還多了一個人要殺。同時國防部長蘿琳哈特利為了幫助特戰軍人，宣布要大刀闊斧改革。凱蒂則發現里斯大腦的實際狀況。

靠著親密戰友的協助，里斯為了逮到殺害他家人的殺手而來到墨西哥。凱蒂躲起來後繼續調查。史帝夫霍恩採取措施保障合頂石的交易。由聖地牙哥聯邦調查局探員東尼萊雲率領的追捕特遣隊，加入追捕叛變海豹隊員詹姆斯里斯。

里斯為了調查一種藥物來到舊金山，此藥可能就是一切的禍源。凱蒂企圖策反麥克泰德斯科，阻礙合頂石對紐寶姆的計畫。東尼和他的小隊緊盯著霍恩，希望能阻止里斯除掉他的下一個目標。

聯邦調查局加大追捕力度，將里斯團團包圍。里斯少了藥，身體和精神上的症狀開始惡化。在執法人員的包圍網中，他下定決心要完成任務，並在不傷害無辜性命的情況下脫逃。

里斯回到科羅納多，制裁背叛他最深的人。他回到家裡，腦中浮現出破碎的回憶。凱蒂為了完成報導，只好配合聯邦調查局的調查。

在國防部長哈特利位於奧卡斯島的宅邸，大戰一觸即發。里斯、凱蒂、班和東尼為了各自的目標全聚集到此地。