Während über die Aktivitäten der Gruppe KNIGHTS in den Nachrichten berichtet wird, nehmen die Herren in Schwarz mit Lain Kontakt auf.

Lain trifft auf Masami Eri, der sich ihr als Gott offenbart. Lains Realität scheint vollkommen zerstört, als ihre Familie und Freunde verschwinden.

Die technische Grenze zwischen dem Wired und der Realworld ist verschwunden. Alice versteht nicht, warum sie von Lains Erinnerungs-Manipulation außer Acht gelassen wurde.

Nachdem der Gott des Wired erloschen ist, sieht Lain nur noch eine Möglichkeit, um die Menschen um sich herum glücklich zu machen …