2005年夏，一场期末家长会正在闷热的海边小城宁州的一中举办。周春红跟其他家长正在认真聆听班主任介绍学期情况，因工作繁忙才从单位赶到的叶军打断了会议进程，这让叶军的女儿叶驰敏感到坐立难安。会后，周春红被老师叫到一旁谈心，老师认为朱朝阳学习成绩虽好，但性格却过于内向，希望家长可以鼓励孩子要多与同学交往，而周春红强硬的态度让谈话陷入尴尬。朱朝阳像其他中学生一样开始了自己的暑假生活。某天，家里两名“不速之客”的到来打破了他的生活。严良带着普普一路从福利院偷跑回宁州，想在他家借宿。另一边，即将退休的民警老陈得知了严良偷跑出福利院的消息。老陈与严良的父亲严文斌是旧识，焦急万分的老陈决心一定要找到严良。永平水产厂的老板朱永平决定带儿子去商场买鞋，其现任妻子王瑶也带着女儿朱晶晶来到商场挑选童衣。朱晶晶玩闹中一脚踩脏了朱朝阳的新鞋，朱朝阳带着委屈回到了家，严良和普普察觉出了朱朝阳的不开心，在两人安慰下，朱朝阳暂时忘记了烦恼，三人开心地约定了明天的六峰山之旅。朱朝阳带普普、严良去自己母亲周春红工作的景区。

在警察面前，张东升表现出愧疚的模样，“张弛有度”的完成了自己的表演。没有留下任何犯罪证据的张东升没料到，自己的杀人过程早已被记录下，而这三个小朋友即将和他展开一场惊险的对抗。三个小孩思虑再三后决定用自己的方式提醒杀人犯，给张东升递警告信。他们还在废船厂找到了一艘隐秘的小船可以当做严良和普普暂时落脚的“秘密基地”。正在派出所值班的老陈突然接到严良的电话，严良询问父亲的情况，但老陈并未告知真相。老陈循着电话线索找到少年宫试图抓住严良，两人几乎 “玩”起了猫抓老鼠的游戏。一番晕头转向的追逐后，老陈终于逮住了严良，正在二人争执时，少年宫里一片嘈杂，有人坠楼了。

朱朝阳趁着张东升不注意偷偷将警告信夹在了摸底试卷里便匆忙离开。另一边，普普将朱晶晶带到了五楼杂物间，好言相劝她不要再欺负人，朱晶晶一头雾水，直到她瞥见朱朝阳，她一口咬定是普普跟朱朝阳合伙要欺负她。朱晶晶情绪激动地咬了一口普普，并爬上窗台大声喊叫。朱朝阳让朱晶晶从窗台上下来，朱晶晶不从，一个脚滑从窗外跌了出去，吓坏了普普与朱朝阳。在现场的老陈疏散人群，严良趁机溜走。刑警队很快也到达了现场，叶军调查现场后，锁定了发生坠落的杂货间。法医从朱晶晶的口腔内提取到了血液样本，叶军嘱咐队员全力排查一切线索。三人汇合后，严良质问二人现场发生了什么，普普解释朱晶晶是自己掉下去的，与他们无关。这场三人谈话最终以朱朝阳不想被爸爸知道自己在场而结束。短暂的借宿结束了，严良和普普准备离开宁州。而此时，危险却向他们逼近。

张东升从警告信上的字迹一路找到了朱朝阳的住处。他在确认孩子们手上确实有视频证据后，和他们达成了交易。朱永平主动带朱朝阳外出过生日。还没坐定，就因为朱晶晶的事离开。朱朝阳只得找到严良和普普来庆祝生日，却发现两个小伙伴通过搬货为他换来了一份生日礼物，朱朝阳感动不已。三个小伙伴来到张东升家想完成交易，张东升给了他们一张银行卡，并承诺以后每星期会往里打三万块，暑假结束就能凑满三十万。严良以为朱朝阳和普普遭遇不测冲进派出所，老陈死活拽着严良去他家吃饭，席间严良一直逼问老陈自己父亲的情况，逼问无果后愤然又准备离去。在叶军的陪同下，朱永平与王瑶观看了事发当天的监控视频，敏感的王瑶察觉出了异样。

认准朱朝阳跟自己女儿死有关的王瑶来到朱朝阳家，朱朝阳遇上恐惧地逃走。两人经过一番追逐后，周春红赶来保护儿子，和王瑶厮打了起来。回家后，母子二人发现楼道被王瑶贴满了告示，朱朝阳难过不已。周春红去找朱永平告知了王瑶所做的“好事”，朱永平心不在焉想敷衍了事。周春红对于朱永平的态度又一次心灰意冷。王瑶从警局得知 DNA 来自女性，她又将怀疑落在了周春红头上。她假扮游客来到景区了解情况，景区的马主任出现为周春红解了围，王瑶认为周春红一定有什么不可告人的秘密。王瑶去了六峰山广播室散布周春红母子杀人的谣言，想以此逼迫周春红说出那天她的行踪。马主任和周春红连忙赶到现场。周春红为了保护儿子的生活不受王瑶的打扰终于吐出实情，现场一片哗然。痛苦的周春红当着众人的面撕开了自己不为人知的秘密。

王瑶万念俱灰，自觉已无计可施。朱永平看着王瑶心生不舍，他希望帮助王瑶让她对朱晶晶的死彻底放下。老陈以严文斌出狱之名骗严良出来，严良果不其然上了钩。严良来到了约定地点，发现来见面的人是老陈。严良认为自己被老陈耍了，生气极了。老陈很诚恳地表明只要答应他回福利院就带严良见他爸。朱永平来少年宫找朱朝阳。他问了朱朝阳一些关于朱晶晶的问题。期间，朱朝阳碰巧发现父亲约他出来其实另有目的，他说了很多和朱永平的美好往事，这让朱永平突然意识到自己根本没有处理好两家的关系，现在居然选择及其愚蠢的方法来化解双方矛盾。在朱朝阳的话语里，朱永平第一次正视了自己对儿子的疏忽，决意好好弥补。朱朝阳在爸爸妈妈那儿受了委屈来到小船找寻严良和普普述说自己的心事，三个小孩相聚海滩，享受着夏天独有的美丽星空，抛弃了一切成人世界带给他们的烦恼和伤害。与此同时，海边，海浪渐渐退去，一具尸体出现在沙滩上。

普普弟弟的病情危重，必须加速交易，朱朝阳只身一人来到张东升家，却不巧碰上叶军。叶军带着叶驰敏来张东升家咨询课程，得知朱朝阳是来补课的，赞许了这个模范生。期间，叶军得知张东升的爱人刚过世，让他对张东升心生怀疑。严良告诉朱朝阳自己准备等普普的弟弟得救后就向警察坦白一切，他请求朱朝阳帮他复制一份视频卡。老陈退休，他告诉严良准备去带他见他爸，老陈意识到要想管教这个孩子只有赢得他的心，他默默开始办理成为严良监护人的手续。严良见到疯疯癫癫的父亲，心里非常难过，又一次逃跑。老陈通过严良电话那头的报站声音找到了他们的秘密基地附近，却正巧碰上了循线索找来的张东升。

老陈来到小白船附近寻找孩子的藏身之处，碰巧遇到同来的张东升，二人攀谈离开后老陈就碰上了正在和渔场小混混纠缠的严良，又因为谈到严良父亲而不欢而散。张东升意识到老陈的存在，会加速事情的败露，决定马上和孩子们完成交易。和小侄女朱晶晶感情甚好的王立从外地归来，王立接受不了可爱的小侄女已经离去的事实，又见姐姐王瑶如此憔悴十分心疼，王立气愤至极要替姐姐教训一下朱朝阳。张东升和孩子们的交易完成，却不想王立也找上朱朝阳，将他抓走，张东升的计划又一次落空。

严良的监护人申请下来了，老陈循着线索找到小白船，遇到和孩子们缠斗的王立，老陈不幸被王立捅倒在地，严良被老陈的勇敢和正气所感染，对这个从小到大都讨厌的人产生了崇敬之情，在得知老陈成为他的监护人后哭成了泪人。普普碰上了前来小船的张东升，乞求张东升救救朱朝阳。张东升答应了普普的请求。王立将朱朝阳拖到水产厂准备教训一番。在这紧急关头，张东升出现，两人搏斗。情急之下张东升将王立杀死并把尸体藏匿在冷库。朱永平赶到水产厂，将朱朝阳送去医院。朱朝阳在医院醒来，父子间进行了一段漫长的谈话，朱永平对儿子表示了歉意和心疼。朱永平不想王立事件再刺激王瑶，他求朱朝阳不要把绑架实情告诉警察。一场暴风雨到来，所有码头停运，严良和普普无法前往哈市，看着生病的普普，严良决定带着普普去找张东升求助。

叶军赶来看望朱朝阳，朱朝阳按照朱永平所愿只说是因为自己不小心而被关进了冷库，其余什么也没透露，这让周春红很生气。回到家中的朱永平把朱朝阳帮他隐瞒实情的事告诉了王瑶，表示要让她尽快找到王立将情况说清楚。老陈在病床上醒来，告诉了叶军王立的特征，叶军迅速展开调查。严良和普普因为借贷公司上门找张东升要债的缘故被张东升安排住进了他的岳父母家。普普因为张东升这几日对他们的关心对他的印象产生了改观。而另一头张东升却无意得知他们还有一张复制卡，这让张东升很气愤，他找到严良逼严良交出了复制卡，可他却发现卡的事另有隐情。普普因为过敏，哮喘病发昏倒，准备打电话叫120的张东升在意识到自己有可能会暴露的时候，犹豫了起来。

严良找到朱朝阳质问他复制卡的事，朱朝阳告诉了他没复制的实情。张东升知道事态已无法控制，决定一网打尽永除后患。叶军去朱永平家走访调查，王瑶一口咬定很久没有见过王立，这引起叶军的怀疑。王瑶因怀疑来到来到水产厂，朱永平也一同前往。张东升将王瑶杀死。朱朝阳和严良也来到水产厂。朱朝阳被张东升拦截绑住并推进冷库，他这才发现自己的爸爸早也已被张东升绑住。张东升逼问朱朝阳复制卡的下落，并表示不会再相信他们。朱永平趁张东升找严良的空隙解开绳索，正准备解救自己的儿子时，张东升返回与其发生搏斗，朱永平不幸被捅倒在地。朱朝阳眼见自己的父亲倒在面前伤痛不已。张东升淋了一地汽油，将冷库反锁，放火准备毁尸灭迹。此时冷库燃起熊熊烈火，张东升逃之夭夭。

逃出火海的二人经历了痛苦的一晚，决定抓住张东升。叶军找到张东升询问朱朝阳的情况，却发现了张东升的异样。在调查六峰山监控时，发现了孩子和张东升都在场的画面。严良想再去见见自己的父亲，迷惘的他被父亲打动，发生了转变。朱朝阳和严良将张东升约上佑领号。在关键时刻，严良不想朱朝阳被张东升蛊惑，走上不归路，以身作则，用自己的生命告诉朱朝阳要做个好人。叶军救下了朱朝阳，而老陈也及时赶到救下了溺水的严良。一切似乎落下帷幕，但孩子们的命运又该何去何从？